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Inst Reports – Überblick über Publikationen der/des IBG-1 für das Berichtsjahr 2025

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Inhalt

Die Publikationen in den Abschnitten A und B sind alle Text-Publikationen, die nach Stand 4.7.2025 für die Programmberichte bzw. den Zentrenfortschrittsbericht für das Jahr 2025 gemeldet werden. Jülicher Autoren sind fett gedruckt.

Stellen Sie bitte sicher, dass dies auch alle Publikationen sind, die aus Ihrem Institut bzw. Institutsbereich gemeldet werden sollen. Als einen Anhaltspunkt für eventuelle Nachtragungen können Sie einen Abgleich mit im „Web of Science“ gefundenen Publikationen nehmen, der stets Anfang November von der Zentralbibliothek verschickt wird.

Beachten Sie, dass u.U. einige der Publikationen in den Abschnitten A bis D noch keine POF-Zuordnung haben. Tragen Sie diese bitte nach, ansonsten werden die betroffenen Publikationen nicht gezählt.

Die Publikationsliste dieses Berichtes gibt es auch als ODS-Datei, allerdings ist nur die aktuelle Webseite verbindlich für das Berichtswesen.

Diese Seite ist ein Dienst der ZB. Fragen können Sie richten an: juser@fz-juelich.de

Der Quellcode, der diesen Bericht erstellt, ist frei verfügbar.

A. ISI/Scopus-referierte Publikationen

Hierzu zählen Publikationen in Journals, die entweder in der Master Journal List „Web of Science Core Collection“ von Clarivate Analytics oder in der „Scopus Source List“ von Elsevier gelistet sind.

Anzahl zählbare Publikationen: 20

TitelAutorenJournal/KonferenzPOFandere Institutezuletzt geändert
SIGHT—A System for Solvent‐Tight Incubation and Growth Monitoring in High ThroughputRönitz, Jakob; Herrmann, Felix; Wynands, Benedikt; Polen, Tino; Wierckx, NickEngineering in life sciences 2171 4.7.2025
Corynebacterium glutamicum: vom Umami-Geschmack zur BioökonomieBott, Michael; Wendisch, Volker F.Biospektrum 2171 4.7.2025
Hydrophobic interaction chromatography (HIC) isotherm incorporating salt-dependent water activity enhances model-based analysis of protein elution profilesJäpel, Ronald; Knödler, Matthias; von Lieres, Eric; Buyel, Johannes FelixJournal of chromatography 2172 4.7.2025
Analyzing time activity curves from spatio-temporal tracer data to determine tracer transport velocity in plantsLanzrath, Hannah; von Lieres, Eric; Metzner, Ralf; Huber, GregorMathematical biosciences 2171 IBG-2 4.7.2025
Engineering of Corynebacterium glutamicum for the synthesis of aromatic compoundsMarienhagen, JanApplied microbiology and biotechnology 2171 4.7.2025
From molasses to purified α-ketoglutarate with engineered Corynebacterium glutamicumHalle, Lars; Höppner, Daniela; Doser, Marvin; Brüsseler, Christian; Gätgens, Jochem; Conen, Niclas; Jupke, Andreas; Marienhagen, Jan; Noack, StephanBioresource technology 2172 4.7.2025
Insights into the morphology-productivity relationship of filamentous fungi through small-scale cultivation and automated microscopy of Thermothelomyces thermophilusRohr, Katja; Geinitz, Bertram; Seiffarth, Johannes; Anbarani, Aydin; Bernauer, Sören; Moch, Matthias; Tenhaef, Julia; Wiechert, Wolfgang; Nöh, Katharina; Oldiges, MarcoBiotechnology progress 2172 4.7.2025
A microfluidic system for the cultivation of cyanobacteria with precise light intensity and CO 2 control: enabling growth data acquisition at single-cell resolutionWitting, Lennart; Seiffarth, Johannes; Stute, Birgit; Schulze, Tim; Hofer, Jan Matthis; Nöh, Katharina; Eisenhut, Marion; Weber, Andreas P. M.; von Lieres, Eric; Kohlheyer, DietrichLab on a chip 2171 4.7.2025
Solving crystallization/precipitation population balance models in CADET, part II: Size-based Smoluchowski coagulation and fragmentation equations in batch and continuous modesZhang, Wendi; Przybycien, Todd; Breuer, Jan Michael; von Lieres, EricComputers & chemical engineering 2172 4.7.2025
Avoiding Replicates in Biocatalysis Experiments: Machine Learning for Enzyme Cascade OptimizationSiedentop, Regine; Siska, Maximilian; Hermes, Johanna; Lütz, Stephan; von Lieres, Eric; Rosenthal, KatrinChemCatChem 2172 4.7.2025
Upcycling of polyamides through chemical hydrolysis and engineered Pseudomonas putidade Witt, Jan; Luthe, Tom; Wiechert, Johanna; Jensen, Kenneth; Polen, Tino; Wirtz, Astrid; Thies, Stephan; Frunzke, Julia; Wynands, Benedikt; Wierckx, NickNature microbiology 2172 4.7.2025
Enzymatic asymmetric synthesis of all stereoisomers of aliphatic, vicinal diols in conventional and non‐conventional mediaNicolas, Maria; Küsters-Spöring, Jan-Dirk; Aufderheide, Chiara; Traving, Helen; Kipp, Carina; Pfennig, Victoria; Bolm, Carsten; Siegert, Petra; Rother, DörteAdvanced synthesis & catalysis 2172 4.7.2025
Engineered Passive Glucose Uptake in Pseudomonas taiwanensis VLB120 Increases Resource Efficiency for BioproductionSchwanemann, Tobias; Krink, Nicolas; Nikel, Pablo I.; Wynands, Benedikt; Wierckx, NickMicrobial biotechnology 2171 4.7.2025
Advancing regulatory dialogue: In silico models for improved vaccine biomanufacturing - an expert meeting reportMeln, Irina; Van Molle, Wim; Vélez, Mónica Perea; Abrahamsen, Greger; Brusselmans, Koen; Calvosa, Eric; Cardillo, Antonio Gaetano; Clénet, Didier; Forestieri, Caroline; Gernaey, Krist V.; Hoefnagel, Marcel; Jorgensen, John Bagterp; Lebrun, Pierre; Natalis, Laurent; Nilsson, Bernt; Öppling, Volker; Pollinger, Julius Carl; Rayat, Andrea C. M. E.; Reem, Daniel; Rubbrecht, Michelle; Schmölder, Johannes; Schofield, Timothy; Smith, Dean; Timmins, Stefanie; von Lieres, Eric; Welin, Mats; Bracewell, Daniel G.Vaccine 2172 4.7.2025
Characterisation and Harnessing of 5‐Hydroxymethylfurfural Metabolism in Pseudomonas umsongensis GO16 for the Production of 2,5‐Furandicarboxylic AcidOrimaco, Rhys; Donnelly, Pauric; Sexton, Seán; McLoughlin, Aoife; Kelly, Sophie; O'Connor, Kevin E.; Wierckx, Nick; Narančić, TanjaMicrobial biotechnology 2172 4.7.2025
Environmental and molecular noise buffering by the cyanobacterial clock in individual cellsEremina, Aleksandra; Schwall, Christian; Saez, Teresa; Witting, Lennart; Kohlheyer, Dietrich; Martins, Bruno M. C.; Thomas, Philipp; Locke, James C. W.Nature Communications 2171 4.7.2025
Unveiling microbial single-cell growth dynamics under rapid periodic oxygen oscillationsKasahara, Keitaro; Seiffarth, Johannes; Stute, Birgit; von Lieres, Eric; Drepper, Thomas; Nöh, Katharina; Kohlheyer, DietrichLab on a chip 2171 4.7.2025
CADET-Julia: Efficient and versatile, open-source simulator for batch chromatography in JuliaFrandsen, Jesper; Breuer, Jan Michael; Schmölder, Johannes; Huusom, Jakob Kjøbsted; Gernaey, Krist V.; Abildskov, Jens; von Lieres, EricComputers & chemical engineering 2172 4.7.2025
Rapid exometabolome footprinting combined with multivariate statistics: A powerful tool for bioprocess optimizationReiter, Alexander; Wesseling, Lars; Wiechert, Wolfgang; Oldiges, MarcoEngineering in life sciences 2171 4.7.2025
Combination of Bio‐ and Organometallic Catalysis for the Synthesis of Dioxolanes in Organic SolventsNicolas, Maria; Gaelings, Niklas; Wiesenthal, Jan; von Westarp, William Graf; Pehlivanlar, Benjamin; Pischinger, Stefan; Jupke, Andreas; Klankermayer, Jürgen; Rother, DörteChemCatChem 2172 4.7.2025

B. Andere referierte Publikationen

Hierzu zählen Publikationen in Journals, die nicht unter (A) fallen. Die Vergabe einer DOI ist zwingende Voraussetzung. Sonderfall Erde und Umwelt: Hier zählen einschließlich Bücher und Buchkapitel.

Anzahl zählbare Publikationen: 0

TitelAutorenJournal/KonferenzPOFandere Institutezuletzt geändert
CRISPR/dCas-mediated counter-silencing: reprogramming dCas proteins into antagonists of xenogeneic silencersJohanna Wiechert; Marie A. Elliot; Julia FrunzkemBio Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 4.7.2025
Genome‐Wide Analysis of <scp>DtxR</scp> and <scp>HrrA</scp> Regulons Reveals Novel Targets and a High Level of Interconnectivity Between Iron and Heme Regulatory Networks in <scp><i>Corynebacterium glutamicum</i></scp>Aileen Krüger; Ulrike Weber; Julia FrunzkeMolecular Microbiology Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 4.7.2025
Biosurfactant biosynthesis by Alcanivorax borkumensis and its role in oil biodegradationJiaxin Cui; Georg Hölzl; Tobias Karmainski; Till Tiso; Sonja Kubicki; Stephan Thies; Lars M. Blank; Karl-Erich Jaeger; Peter DörmannNature Chemical Biology Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IMET 4.7.2025
Asymmetric Synthesis of C–N Axially Chiral Carbazoles via Axial-to-Axial Chirality TransferSebastian Myllek; Moritz Klischan; Philipp Neudecker; Martin Breugst; Birgit HenssenOrganic & Biomolecular Chemistry Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IBI-7, IBOC 4.7.2025
ALE reveals a surprising link between [Fe-S] cluster formation, tryptophan biosynthesis and the potential regulatory protein TrpP in Corynebacterium glutamicumRico Zuchowski; Simone Schito; Christina Mack; Astrid Wirtz; Michael Bott; Tino Polen; Stephan Noack; Meike BaumgartBMC Microbiology Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 4.7.2025
Chemoenzymatic Total Synthesis of Lansai BMona Haase; Julia Tenhaef; Stephan Noack; Birgit HenssenChemistry - A European Journal Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IBOC 4.7.2025

C. Datenpublikationen (teilweise auch Software)

Hierzu zählen Publikationen, die in JuSER verzeichnet sind.

Fehlende POF-Zuordnungen muss man in JuSER nachtragen.

Da auf Jülich DATA bislang noch nicht zwischen Daten- und Software-Publikationen unterschieden wird, wird hier teilweise auch Software verzeichnet. Das ist aktuell für das Berichtswesen noch nicht kritisch und wird ab dem nächsten Jahr vermieden.

Anzahl zählbare Publikationen: 1

TitelAutorenPOFandere Institutezuletzt geändert
A Sustainable Method for Potato Side Stream Valorisation to Obtain Steroidal Glycoalkaloids within a Bioeconomy ApproachNina Stadler; Birgit Henßen; Jörg Pietruzska; Thomas Classen 2171; 2172 4.7.2025

D. Software-Publikationen

Hierzu zählen Publikationen, die in JuSER verzeichnet sind.

Fehlende POF-Zuordnungen muss man in JuSER nachtragen.

Anzahl zählbare Publikationen: 0

TitelAutorenPOFandere Institutezuletzt geändert
CADET-Process: Version 0.11.0Johannes Schmölder; Jäpel, Ronald; Schunck, Florian; Klauß, Daniel; Hannah Lanzrath; Berger, Antonia Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 4.7.2025
CADET-Process: Version 0.9.0Johannes Schmölder; Schunck, Florian; Jäpel, Ronald Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 4.7.2025