← Zurück zur Institutsliste

Inst Reports – Überblick über Publikationen der/des IBG-1 für das Berichtsjahr 2026

Diese Seite wird zu jeder vollen Stunde aktualisiert. Sie können diesen Link in Ihre Bookmarks übernehmen.

Inhalt

Die Publikationen in den Abschnitten A und B sind alle Text-Publikationen, die nach Stand 13.7.2026 für die Programmberichte bzw. den Zentrenfortschrittsbericht für das Jahr 2026 gemeldet werden. Jülicher Autoren sind fett gedruckt.

Stellen Sie bitte sicher, dass dies auch alle Publikationen sind, die aus Ihrem Institut bzw. Institutsbereich gemeldet werden sollen.

Beachten Sie, dass u.U. einige der Publikationen in den Abschnitten A bis D noch keine POF-Zuordnung haben. Tragen Sie diese bitte nach, ansonsten werden die betroffenen Publikationen nicht gezählt.

Die Publikationsliste dieses Berichtes gibt es auch als ODS-Datei, allerdings ist nur die aktuelle Webseite verbindlich für das Berichtswesen.

Diese Seite ist ein Dienst der ZB. Fragen können Sie richten an: juser@fz-juelich.de

Der Quellcode, der diesen Bericht erstellt, ist frei verfügbar.

A. ISI/Scopus-referierte Publikationen

Hierzu zählen Publikationen in Journals, die entweder in der Master Journal List „Web of Science Core Collection“ von Clarivate Analytics oder in der „Scopus Source List“ von Elsevier gelistet sind.

Anzahl zählbare Publikationen: 14

TitelAutorenJournal/KonferenzPOFandere Institutezuletzt geändert
A Guide to Bayesian Optimization in Bioprocess EngineeringSiska, Maximilian; Pajak, Emma; Rosenthal, Katrin; del Rio Chanona, Antonio; von Lieres, Eric; Helleckes, Laura M.Biotechnology and Bioengineering / Symposium 2172 13.7.2026
Evolutionary engineering of Geobacillus thermoleovorans for growth on adipic acid and 1,4-butanediolOp de Hipt, Leonie; Jäger, Amelie; Luthe, Tom; Cevik, Volkan Julio; Kranz, Angela; Wynands, Benedikt; Frunzke, Julia; Usadel, Björn; Wierckx, NickApplied microbiology and biotechnology 2171 IBG-4 13.7.2026
Metabolic engineering of Corynebacterium glutamicum for the production of the low-caloric natural sweetener D-allulose via phosphorylated intermediatesLehnert, Alexander; Deditius, Maja; Wirtz, Astrid; Baumgart, Meike; Bott, MichaelMetabolic engineering 2171 13.7.2026
A Novel Biosensor for Ferrous Iron Developed via CoBiSe: A Computational Method for Rapid Biosensor DesignPapadopoulos, Athanasios; Anlauf, Manuel T.; Reiners, Jens; Paik, Seung-Hyun; Krüger, Aileen; Lückel, Benita; Bott, Michael; Drepper, Thomas; Frunzke, Julia; Gohlke, Holger; Weidtkamp-Peters, Stefanie; Smits, Sander H. J.; Gertzen, Christoph G. W.ACS sensors 2171; 2172 IBG-4, IMET 13.7.2026
Growth of Corynebacterium glutamicum on 5-oxo-L-proline (pyroglutamate) as a carbon and nitrogen source requires the PxpR-controlled pxpTABC genesSundermeyer, Lea; Mack, Christina; Matamouros, Susana; Bott, MichaelApplied and environmental microbiology 2171 13.7.2026
Process integration of enzymatic and microbial PBAT conversion with a Pseudomonas taiwanensis mixed cultureOp de Hipt, Leonie; Siracusa, Chiara; Wynands, Benedikt; Thies, Stephan; Pellis, Alessandro; Quartinello, Felice; Guebitz, Georg M.; Wierckx, NickSystems microbiology and biomanufacturing 2171 13.7.2026
DNA-intercalating antiphage molecules trigger abortive infection through mutual destruction and synergize with bacterial immunityErnst, Larissa; Gätgens, Cornelia; Rackow, Bente; Pozhydaieva, Nadiia; Gaaloul, Elyès; Krüger, Aileen; Seiffarth, Johannes; Bund, Michelle; Joisten-Rosenthal, Vivien; Kohlheyer, Dietrich; Usadel, Björn; Harms, Alexander; Höfer, Katharina; Frunzke, JuliaProceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 2171 IBG-4 13.7.2026
Engineering Pseudomonas taiwanensis for efficient chorismate-based production of mono- and dihydroxybenzoatesKofler, Franziska; Schwanemann, Tobias; Teófilo da Silva, Nadine; Wierckx, Nick; Wynands, BenediktMetabolic engineering communications 2171 13.7.2026
Second regulatory workshop on utilising in silico models to expedite vaccine development, testing, and lifecycle management - an expert meeting reportMeln, Irina; Van Molle, Wim; Vélez, Mónica Perea; Baay, Marc; Bracewell, Daniel G.; Brusselmans, Koen; Cardillo, Antonio Gaetano; Clénet, Didier; Forestieri, Caroline; Girardon, Lea; Gudjonsson, Arnar; Guzzi, Antonio; Hesselink, Renske; Jørgensen, John Bagterp; Lanzrath, Hannah; Lebrun, Pierre; Li, Xiyan; von Lieres, Eric; Mansois, Noémie; Natalis, Laurent; Pollinger, Julius Carl; García, Laura Rodríguez; Şenel, Sevda; Spruth, Martin; Welin, Mats; Olesen, Ole F.; Calvosa, EricVaccine 2172 13.7.2026
Expanding the substrate spectrum in engineered Pseudomonas taiwanensis for efficient production of 4-coumarate from lignocellulosic sugarsWynands, Benedikt; Feltes, Sophia; Teófilo da Silva, Nadine; Polen, Tino; Wierckx, NickMicrobial cell factories 2171 13.7.2026
Dimer asymmetry in signaling of blue-light sensor histidine kinasesKrauss, Ulrich; Arinkin, Vladimir; Stadler, Andreas; Meier, Stefanie; Jaeger, Karl-Erich; Möglich, Andreas; Batra-Safferling, RenuScience advances 5241 IBI-7 13.7.2026
Turbid but accurate: automating lysostaphin quantification including uncertainty quantificationPrigolovkin, Lisa; Osthege, Michael; Siska, Maximilian; Sander, Josefin; Hoffzimmer, Anja; Wiechert, Wolfgang; Desiderato, Christian K.; Riedel, Christian U.; Oldiges, MarcoMicrobial cell factories 2172 13.7.2026
Rapid Identification of Superior Endogenous Signal Peptides for Heterologous Protein Secretion by Corynebacterium glutamicum Through Modular Cloning and AutomationMatamouros, Susana; Tenhaef, Julia; Bida, Astrid; Noack, Stephan; Bott, MichaelMicrobial biotechnology 2171 13.7.2026
Characterisation of the N-Methyltransferase SgPsmC: Application in the Kinetic Resolution of PyrroloindolinesChapple, Benjamin; Nitz, Lia; Schneider, Pascal; Henssen, Birgit; Myllek, Sebastian; Haase, Mona; Classen, Thomas; Pietruszka, JörgAngewandte Chemie / International edition 2172 IBOC 13.7.2026

B. Andere referierte Publikationen

Hierzu zählen Publikationen in Journals, die nicht unter (A) fallen. Die Vergabe einer DOI ist zwingende Voraussetzung. Sonderfall Erde und Umwelt: Hier zählen einschließlich Bücher und Buchkapitel.

Anzahl zählbare Publikationen: 0

TitelAutorenJournal/KonferenzPOFandere Institutezuletzt geändert
Development and optimization of a glycerol-based fed-batch strategy for the production of peroxidases with Komagataella phaffii under the PDF promoterXavier Garcia‐Ortega; Anton Glieder; Wolfgang Wiechert; Marco OldigesMicrobial Cell Factories Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 11.7.2026
Integrated Strain, Bioprocess, and Polymerization Development for Production of a Bio-Based 4-Hydroxyphenylacetic Acid PolymerBenedikt Wynands; Jeppe Madsen; Nick Wierckx; Anders Egede Daugaard; Lars RegesteinACS Sustainable Chemistry & Engineering Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 10.7.2026
SAM-dependent methyltransferases: from chemoenzymatic natural product synthesis to industrial applicationBenjamin Chapple; Diana-Alexandra Amariei; Martin A. Hayes; Birgit HenssenNatural Product Reports Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IBOC 10.7.2026
Phage biocontrol reduces the disease burden and modulates plant immunity through suppression of bacterial virulenceSebastian Erdrich; Swati Sharma; Milan Župunski; Ulrich Schurr; Guido Großmann; Borjana ArsovaCell Reports Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IBG-2 10.7.2026
Concatenating microorganisms, chemical catalysts, and enzymes for the synthesis of ethyl formate from renewablesNina Klos; Philipp Demling; Giancarlo FranciòGreen Chemistry Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 10.7.2026
Additional file 1 of Expanding the substrate spectrum in engineered Pseudomonas taiwanensis for efficient production of 4-coumarate from lignocellulosic sugarsBenedikt Wynands; Tino Polen; Nick WierckxFigshare Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 10.7.2026
Additional file 1 of Expanding the substrate spectrum in engineered Pseudomonas taiwanensis for efficient production of 4-coumarate from lignocellulosic sugarsBenedikt Wynands; Tino Polen; Nick WierckxFigshare Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 10.7.2026
Stereoselective Prenylation of Aryl- and Heteroaryl Halides: γ-Selective Suzuki–Miyaura Coupling as a Tool for Asymmetric Csp <sup>2</sup> –Csp <sup>3</sup> Cross-CouplingMona Haase; Birgit HenssenThe Journal of Organic Chemistry Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IBOC 10.7.2026
Lipase-Assisted Removal of Spin Finishes from Synthetic Fibre TextilesRebecka Molitor; Stephan Thies; Jan Modregger; Karl-Erich Jaeger; Nazanin Ansari; Manuel Ferrer; Carla C. C. R. de CarvalhoTextiles Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IMET 10.7.2026
AhfA is required for mycolic acid homeostasis and cell envelope integrity in CorynebacterialesJan Marienhagen; Apoorva Bhatt Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 10.7.2026
Establishment of a Single‐Cell Minimal Medium: A Case Study for Microfluidic Cultivation of <i>Corynebacterium glutamicum</i>Matthias Pesch; Dietrich Kohlheyer; Alexander GrünbergerBiotechnology and Bioengineering Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 10.7.2026
Rethinking the loop: toward integrated strain and bioprocess developmentTim Stoltmann; Stephan NoackCurrent Opinion in Biotechnology Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 10.7.2026
Front Cover Image, Volume 123, Number 4, April 2026Katrin Rosenthal; Eric von LieresBiotechnology and Bioengineering Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 10.7.2026
On the effect of missing transmission chain information in agent-based models: Outcomes of superspreading events and workplace transmissionSascha Korf; Gerta Köster; Martin J. KühnChaos Solitons & Fractals Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 10.7.2026
Gas chromatography analysis of fatty acid esters and free fatty acids for the evaluation of lipase performance in textile treatment and washingNazanin Ansari; Jan Modregger; Rebecka Molitor; Stephan Thies; Manuel Ferrer; Carla C. C. R. de CarvalhoBioresource Technology Reports Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IMET 10.7.2026
Automated assays accelerate bioprocess development for the production of peroxidases in Komagataella phaffiiAnton Glieder; Wolfgang Wiechert; Marco OldigesBiotechnology for the Environment Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 14.3.2026
Live-cell imaging enables reporter-free monitoring of the circadian rhythm in individual <i>Synechocystis</i> cellsЕ. В. Иванова; Dietrich Kohlheyer; Anika Wiegard; Ilka M. Axmann Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 28.2.2026
DNA-intercalating antiphage molecules trigger abortive infection through ‘mutual destruction’ and synergize with bacterial immunityLarissa N. Ernst; Bente Rackow; Johannes Seiffarth; Vivien Joisten-Rosenthal; Björn Usadel; Alexander Harms; Julia Frunzke Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IBG-4 28.2.2026
A cloud-enabled digital twin platform for upstream processing in biotechnology: Integrating CFD, compartmentalization, and reaction kineticsXiyan Li; Johan le Nepvou de Carfort; Johannes Schmölder; Eric von Lieres; Krist V. GernaeyComputers & Chemical Engineering Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 22.2.2026
PyUAT: An open-source Python framework for uncertainty-aware, efficient, and scalable model-driven cell trackingJohannes Seiffarth; Katharina NöhPLoS ONE Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 12.2.2026
Charakterisierung der <i>N</i> ‐Methyltransferase <i>Sg</i> PsmC: Anwendung in der kinetischen Racematspaltung von PyrroloindolinenPascal Schneider; Sebastian Myllek; Mona Haase; Thomas Classen; Jörg PietruszkaAngewandte Chemie Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IBOC 12.2.2026
Beyond the tuber: crafting high-value molecules from potato residuesMarilia Bueno Da Silva; Anika Wiese-Klinkenberg; Florian M. W. Grundler; Björn Usadel; Franziska Genzel; Thomas Classen; Jörg PietruszkaPhytochemistry Letters Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IBG-4 12.2.2026
Multi-enzymatic approaches involving engineered D-amino acid dehydrogenases for the stereoselective synthesis of D-phenylalaninesKrisztina Boros; Laurent Gal; Raluca Bianca Tomoiagă; Jörg Pietruszka; László Csaba BenczeNew Biotechnology Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 12.2.2026
De novo production of valuable aromatic aldehydes and aldehyde-derived products by engineered solvent-tolerant and oxidation-deficient Pseudomonas taiwanensis VLB120Thorsten Lechtenberg; Benedikt Wynands; Nick WierckxNew Biotechnology Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 12.2.2026

C. Datenpublikationen (teilweise auch Software)

Hierzu zählen Publikationen, die in JuSER verzeichnet sind.

Fehlende POF-Zuordnungen muss man in JuSER nachtragen.

Da auf Jülich DATA bislang noch nicht zwischen Daten- und Software-Publikationen unterschieden wird, wird hier teilweise auch Software verzeichnet. Das ist aktuell für das Berichtswesen noch nicht kritisch und wird ab dem nächsten Jahr vermieden.

Anzahl zählbare Publikationen: 0

TitelAutorenPOFandere Institutezuletzt geändert
Scalable and Green Extraction of Enantiopure Sparteine from Lupinus Species: A Comparative E-Factor StudyPhilipp Sowa; Marco Loehrer; Ashley Beers; Vera Ophoven; Birgit Henßen; Andreas Sebastian Klein; Jörg Pietruszka; Thomas Classen Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 10.7.2026
Dimer asymmetry in signaling of blue-light sensor histidine kinasesUlrich Krauss Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 10.7.2026
Dimer asymmetry in signaling of blue-light sensor histidine kinasesUlrich Krauss Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 10.7.2026
Replication Data for: Seed Ripening and Quinolizidine Alkaloid Dynamics in Lupinus mutabilis: From Gene Activity to MetabolitePhilipp Sowa; Jochem Gätgens; Ashley Beers; Jörg Pietruszka; Stephan Noack; Thomas Classen Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 28.2.2026
Ultra low-cost microfluidic live-cell imaging (UL-MLCI) datasetSeiffarth, Johannes; Matthias Pesch; Dietrich Kohlheyer; Katharina Nöh Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 12.2.2026
Ultra low-cost microfluidic live-cell imaging (UL-MLCI) datasetSeiffarth, Johannes; Matthias Pesch; Dietrich Kohlheyer; Katharina Nöh Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 12.2.2026
data for 13CFLUX – Third generation high-performance simulator for 13C metabolic flux analysisJohann Fredrik Jadebeck; Anton Stratmann; Martin Beyss; Katharina Nöh Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IBG-1-TAW 12.2.2026
Replication Data for: HOPS: high-performance library for (non-)uniform sampling of convex-constrained modelsJohann F. Jadebeck; Axel Theorell; Samuel Leweke; Katharina Nöh Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 12.2.2026

D. Software-Publikationen

Hierzu zählen Publikationen, die in JuSER verzeichnet sind.

Fehlende POF-Zuordnungen muss man in JuSER nachtragen.

Anzahl zählbare Publikationen: 0

TitelAutorenPOFandere Institutezuletzt geändert
MEmilio v2.4.0 - A high performance Modular EpideMIcs simuLatIOn softwareBicker, Julia; Gerstein, Carlotta; Kerkmann, David; Sascha Korf; Schmieding, René; Wendler, Anna; Zunker, Henrik; Daniel Abele; Betz, Maximilian; Nguyen, Khoa; Plötzke, Lena; Volmer, Kilian; Schmidt, Agatha; Waßmuth, Nils; Lenz, Patrick; Richter, Daniel; Tritzschak, Hannah; Hannemann-Tamas, Ralf; Litz, Julian; Borges, Marielena Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! JSC 10.7.2026
Event-Aware Hybrid Neural Ordinary Differential Equations for Bolus-Shot Feeding of Chinese Hamster Ovary CellsBofarull-Manzano, Ignasi; Zahel, Thomas; Zagatti, Guilherme Augusto; Eric von Lieres Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 10.7.2026
Event-Aware Hybrid Neural Ordinary Differential Equations for Bolus-Shot Feeding of Chinese Hamster Ovary CellsBofarull-Manzano, Ignasi; Zahel, Thomas; Zagatti, Guilherme Augusto; Eric von Lieres Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 10.7.2026
CADET-Core: Version 6.0.0-alpha.2Jan Breuer; Samuel Leweke; Johannes Schmölder; Berger, Antonia; Hannah Lanzrath; Zhang, Wendi; Jazib Hassan; Eric von Lieres Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 10.7.2026
CADET-Core: Version 6.0.0-alpha.1Jan Breuer; Samuel Leweke; Johannes Schmölder; Berger, Antonia; Hannah Lanzrath; Zhang, Wendi; Jäpel, Ronald; Jayghosh Subodh Rao; Jazib Hassan; William Heymann; Eric von Lieres Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 28.2.2026
CADET-Core: Version 6.0.0-alpha.1Jan Breuer; Samuel Leweke; Johannes Schmölder; Berger, Antonia; Hannah Lanzrath; Zhang, Wendi; Jäpel, Ronald; Jayghosh Subodh Rao; Jazib Hassan; William Heymann; Eric von Lieres Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 28.2.2026
13CFLUX: Version 3.0.0a2Anton Stratmann; Martin Beyss; Johann Fredrik Jadebeck; Katharina Nöh Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IBG-1-TAW 12.2.2026
13CFLUX: Version 3.0.0a2Anton Stratmann; Martin Beyss; Johann Fredrik Jadebeck; Katharina Nöh Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IBG-1-TAW 12.2.2026
JuBiotech/Supplement-to-Prigolovkin-et-al.-2025: 2025-09-02Lisa Prigolovkin; Michael Osthege; Siska, Maximilian; Sander, Josefin; Hoffzimmer, Anja; Wolfgang Wiechert; Desiderato, Christian K.; Riedel, Christian U.; Marco Oldiges Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 12.2.2026
CADET-Process: Version 0.9.0Johannes Schmölder; Schunck, Florian; Jäpel, Ronald Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 12.2.2026