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Inst Reports – Überblick über Publikationen der/des IBG-4 für das Berichtsjahr 2024

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Inhalt

Die Publikationen in den Abschnitten A und B sind alle Text-Publikationen, die nach Stand 9.3.2025 für die Programmberichte bzw. den Zentrenfortschrittsbericht für das Jahr 2024 gemeldet werden. Jülicher Autoren sind fett gedruckt.

Stellen Sie bitte sicher, dass dies auch alle Publikationen sind, die aus Ihrem Institut bzw. Institutsbereich gemeldet werden sollen. Als einen Anhaltspunkt für eventuelle Nachtragungen können Sie einen Abgleich mit im „Web of Science“ gefundenen Publikationen nehmen, der stets Anfang November von der Zentralbibliothek verschickt wird.

Beachten Sie, dass u.U. einige der Publikationen in den Abschnitten A bis D noch keine POF-Zuordnung haben. Tragen Sie diese bitte nach, ansonsten werden die betroffenen Publikationen nicht gezählt.

Die Publikationsliste dieses Berichtes gibt es auch als ODS-Datei, allerdings ist nur die aktuelle Webseite verbindlich für das Berichtswesen.

Diese Seite ist ein Dienst der ZB. Fragen können Sie richten an: juser@fz-juelich.de

Der Quellcode, der diesen Bericht erstellt, ist frei verfügbar.

A. ISI/Scopus-referierte Publikationen

Hierzu zählen Publikationen in Journals, die entweder in der Master Journal List „Web of Science Core Collection“ von Clarivate Analytics oder in der „Scopus Source List“ von Elsevier gelistet sind.

Anzahl zählbare Publikationen: 28

TitelAutorenJournal/KonferenzPOFandere Institutezuletzt geändert
Deep learning the cis-regulatory code for gene expression in selected model plantsPeleke, Fritz Forbang; Zumkeller, Simon Maria; Gültas, Mehmet; Schmitt, Armin; Szymański, JędrzejNature Communications 2171 9.3.2025
In‐depth exploration of the genomic diversity in tea varieties based on a newly constructed pangenome of Camellia sinensisTariq, Arslan; Meng, Minghui; Jiang, Xiaohui; Bolger, Anthony; Beier, Sebastian; Buchmann, Jan P.; Fernie, Alisdair R.; Wen, Weiwei; Usadel, BjörnThe plant journal 2171 9.3.2025
Synthesis and biological evaluation of novel MB327 analogs as resensitizers for desensitized nicotinic acetylcholine receptors after intoxication with nerve agentsBernauer, Tamara; Nitsche, Valentin; Kaiser, Jesko; Gertzen, Christoph G. W.; Höfner, Georg; Niessen, Karin V.; Seeger, Thomas; Steinritz, Dirk; Worek, Franz; Gohlke, Holger; Wanner, Klaus T.; Paintner, Franz F.Toxicology letters 2171 9.3.2025
Molecular Mechanisms Underlying Medium-Chain Free Fatty Acid-Regulated Activity of the Phospholipase PlaF from Pseudomonas aeruginosaGentile, Rocco; Modric, Matea; Thiele, Björn; Jaeger, Karl-Erich; Kovacic, Filip; Schott-Verdugo, Stephan; Gohlke, HolgerJACS Au 2172; 2173 IBG-2, IMET, IBG-3 9.3.2025
Mechanical forces orchestrate the metabolism of the developing oilseed rape embryoRolletschek, Hardy; Muszynska, Aleksandra; Schwender, Jörg; Radchuk, Volodymyr; Heinemann, Björn; Hilo, Alexander; Plutenko, Iaroslav; Keil, Peter; Ortleb, Stefan; Wagner, Steffen; Kalms, Laura; Gündel, André; Shi, Hai; Fuchs, Jörg; Szymanski, Jedrzej Jakub; Braun, Hans-Peter; Borisjuk, LjudmillaThe new phytologist 2171 9.3.2025
Directed evolution of C-methyltransferase PsmD for enantioselective pyrroloindole derivative productionAmariei, Diana A.; Tenhaef, Julia; Classen, Thomas; David, Benoit; Rosch, Tobias M.; Gohlke, Holger; Noack, Stephan; Pietruszka, JörgCatalysis science & technology 2171 IBG-1, IBOC 9.3.2025
The metagenome‐derived esterase PET40 is highly promiscuous and hydrolyses polyethylene terephthalate ( PET )Zhang, Hongli; Dierkes, Robert F.; Perez-Garcia, Pablo; Costanzi, Elisa; Dittrich, Jonas; Cea, Pablo A.; Gurschke, Marno; Applegate, Violetta; Partus, Kristina; Schmeisser, Christel; Pfleger, Christopher; Gohlke, Holger; Smits, Sander H. J.; Chow, Jennifer; Streit, Wolfgang R.The FEBS journal 2171; 5111 I:(DE-Juel1)NIC-20090406, JSC 9.3.2025
Metabolomic and transcriptomic analyses of yellow-flowered crocuses to infer alternative sources of saffron metabolitesNemati, Zahra; Kazemi-Shahandashti, Seyyedeh-Sanam; Garibay-Hernández, Adriana; Mock, Hans-Peter; Schmidt, Maximilian; Usadel, Björn; Blattner, Frank R.BMC plant biology 2171 9.3.2025
The ISG15-Protease USP18 Is a Pleiotropic Enhancer of HIV-1 ReplicationLin, Chaohui; Kuffour, Edmund Osei; Li, Taolan; Gertzen, Christoph G. W.; Kaiser, Jesko; Luedde, Tom; König, Renate; Gohlke, Holger; Münk, CarstenViruses 5111 9.3.2025
Characterization of Size-tuneable Aescin-Lipid Nanoparticles as Platform for Stabilization of Membrane ProteinsEscobedo, Fatima; Gospalswamy, Mohanraj; Hägerbäumer, Pia; Stank, Tim Julian; Victor, Julian; Groth, Georg; Gohlke, Holger; Dargel, Carina; Hellweg, Thomas; Etzkorn, ManuelColloids and surfaces / B 2171 IBI-7 9.3.2025
Extracting binding energies and binding modes from biomolecular simulations of fragment binding to endothiapepsinSchmitz, Birte; Frieg, Benedikt; Homeyer, Nadine; Jessen, Gisela; Gohlke, HolgerArchiv der Pharmazie 5111; 2171 JSC, I:(DE-Juel1)NIC-20090406, IBI-7 9.3.2025
Long-read transcriptome sequencing of CLL and MDS patients uncovers molecular effects of SF3B1 mutationsPacholewska, Alicja; Lienhard, Matthias; Brüggemann, Mirko; Hänel, Heike; Bilalli, Lorina; Königs, Anja; Heß, Felix; Becker, Kerstin; Köhrer, Karl; Kaiser, Jesko; Gohlke, Holger; Gattermann, Norbert; Hallek, Michael; Herling, Carmen D.; König, Julian; Grimm, Christina; Herwig, Ralf; Zarnack, Kathi; Schweiger, Michal R.Genome research 2171 9.3.2025
Depicting the genetic and metabolic panorama of chemical diversity in the tea plantQiu, Haiji; Zhang, Xiaoliang; Zhang, Youjun; Jiang, Xiaohui; Ren, Yujia; Gao, Dawei; Zhu, Xiang; Usadel, Björn; Fernie, Alisdair R.; Wen, WeiweiPlant biotechnology journal 2171 9.3.2025
Aplospojaveedins A–C, unusual sulfur-containing alkaloids produced by the endophytic fungus Aplosporella javeedii using OSMAC strategyGao, Ying; Frank, Marian; Teusch, Nicole; Woschko, Dennis; Janiak, Christoph; Mándi, Attila; Kurtán, Tibor; Hartmann, Rudolf; Schiedlauske, Katja; van Geelen, Lasse; Kalscheuer, Rainer; Kaiser, Jesko; Gertzen, Christoph G. W.; Gohlke, Holger; Wang, Bin; Proksch, Peter; Liu, ZhenFrontiers in microbiology 2171 IBI-7 9.3.2025
Haplotype-resolved assembly of a tetraploid potato genome using long reads and low-depth offspring dataSerra Mari, Rebecca; Schrinner, Sven; Finkers, Richard; Ziegler, Freya; Arens, Paul; Schmidt, Maximilian H.-W.; Usadel, Björn; Klau, Gunnar W.; Marschall, TobiasGenome biology 2171 9.3.2025
Novel 4-alkoxy Meriolin Congeners Potently Induce Apoptosis in Leukemia and Lymphoma CellsKrings, Karina S.; Wassenberg, Tobias R.; Cea-Medina, Pablo; Schmitt, Laura; Lechtenberg, Ilka; Llewellyn, Tanya R.; Qin, Nan; Gohlke, Holger; Wesselborg, Sebastian; Müller, Thomas J. J.Molecules 2171 9.3.2025
Molecular Mechanisms Underlying Single Nucleotide Polymorphism-Induced Reactivity Decrease in CYP2D6Becker, Daniel; Bharatam, Prasad V.; Gohlke, HolgerJournal of chemical information and modeling 2171 9.3.2025
Deciphering the Therapeutic Potential of Novel Pentyloxyamide-Based Class I, IIb HDAC Inhibitors against Therapy-Resistant LeukemiaFischer, Fabian; Schliehe-Diecks, Julian; Tu, Jia-Wey; Gangnus, Tanja; Ho, Yu Lin; Hebeis, Mara; Alves Avelar, Leandro A.; Scharov, Katerina; Watrin, Titus; Kemkes, Marie; Stachura, Pawel; Daugs, Katharina; Biermann, Lukas; Kremeyer, Josefa; Horstick, Nadine; Span, Ingrid; Pandyra, Aleksandra A.; Borkhardt, Arndt; Gohlke, Holger; Kassack, Matthias U.; Burckhardt, Bjoern B.; Bhatia, Sanil; Kurz, ThomasJournal of medicinal chemistry 2171 9.3.2025
The Antioxidant and HDAC-Inhibitor α-Lipoic Acid Is Synergistic with Exemestane in Estrogen Receptor-Positive Breast Cancer CellsPradel, Laura S.; Ho, Yu-Lin; Gohlke, Holger; Kassack, Matthias U.International journal of molecular sciences 2171 9.3.2025
Potato Berries as a Valuable Source of Compounds Potentially Applicable in Crop Protection and Pharmaceutical Sectors: A ReviewBueno da Silva, Marília; Wiese-Klinkenberg, Anika; Usadel, Björn; Genzel, FranziskaJournal of agricultural and food chemistry 2171 9.3.2025
Taken to extremes: Loss of plastid rpl32 in Streptophyta and Cuscuta’s unconventional solution for its replacementFischer, Karsten; Valentin Jordbræk, Sondre; Olsen, Stian; Bockwoldt, Mathias; Schwacke, Rainer; Usadel, Björn; Krause, KirstenMolecular phylogenetics and evolution 2171 9.3.2025
Identification of ligands binding to MB327-PAM-1, a binding pocket relevant for resensitization of nAChRsKaiser, Jesko; Gertzen, Christoph G. W.; Bernauer, Tamara; Nitsche, Valentin; Höfner, Georg; Niessen, Karin V.; Seeger, Thomas; Paintner, Franz F.; Wanner, Klaus T.; Steinritz, Dirk; Worek, Franz; Gohlke, HolgerToxicology letters 2171 9.3.2025
MS Binding Assays with UNC0642 as reporter ligand for the MB327 binding site of the nicotinic acetylcholine receptorNitsche, Valentin; Höfner, Georg; Kaiser, Jesko; Gertzen, Christoph G. W.; Seeger, Thomas; Niessen, Karin V.; Steinritz, Dirk; Worek, Franz; Gohlke, Holger; Paintner, Franz F.; Wanner, Klaus T.Toxicology letters 2171 9.3.2025
Novel meriolin derivatives potently inhibit cell cycle progression and transcription in leukemia and lymphoma cells via inhibition of cyclin-dependent kinases (CDKs)Schmitt, Laura; Hoppe, Julia; Cea-Medina, Pablo; Bruch, Peter-Martin; Krings, Karina S.; Lechtenberg, Ilka; Drießen, Daniel; Peter, Christoph; Bhatia, Sanil; Dietrich, Sascha; Stork, Björn; Fritz, Gerhard; Gohlke, Holger; Müller, Thomas J. J.; Wesselborg, SebastianCell death discovery 2171 9.3.2025
Structure and dimerization properties of the plant-specific copper chaperone CCHDluhosch, Dominik; Kersten, Lisa Sophie; Schott-Verdugo, Stephan; Hoppen, Claudia; Schwarten, Melanie; Willbold, Dieter; Gohlke, Holger; Groth, GeorgScientific reports 2171; 5241 IBI-7 9.3.2025
A roadmap for a middleware as a federation service for integrative data retrieval of agricultural dataGarcía Brizuela, Jorge; Scharfenberg, Carsten; Scheuner, Carmen; Hoedt, Florian; König, Patrick; Kranz, Angela; Leidel, Antonia; Martini, Daniel; Schneider, Gabriel; Schneider, Julian; Singson, Lea Sophie; von Waldow, Harald; Wehrmeyer, Nils; Usadel, Björn; Lesch, Stephan; Specka, Xenia; Lange, Matthias; Arend, DanielJournal of integrative bioinformatics 2171 9.3.2025
Integrated multi‐omics analyses and genome‐wide association studies reveal prime candidate genes of metabolic and vegetative growth variation in canolaKnoch, Dominic; Meyer, Rhonda C.; Heuermann, Marc C.; Riewe, David; Peleke, Fritz F.; Szymański, Jędrzej Jakub; Abbadi, Amine; Snowdon, Rod J.; Altmann, ThomasThe plant journal 2171 9.3.2025
A comparative electronic structure analysis of reactive metabolites of oxicamsBurman, Joydeep; Manchanda, Kanika; Bhakhar, Kaushikkumar A.; Boharupi, Akshay N.; Gohlke, Holger; Bharatam, Prasad V.Computational and theoretical chemistry 2171 9.3.2025

B. Andere referierte Publikationen

Hierzu zählen Publikationen in Journals, die nicht unter (A) fallen. Die Vergabe einer DOI ist zwingende Voraussetzung. Sonderfall Erde und Umwelt: Hier zählen einschließlich Bücher und Buchkapitel.

Anzahl zählbare Publikationen: 0

TitelAutorenJournal/KonferenzPOFandere Institutezuletzt geändert
Characterization of a <i>C</i>-methyltransferase from <i>Streptomyces </i><i>griseoviridis</i> – crystal structure, mechanism, and substrate scopeMona Haase; Oliver H. Weiergräber; Benoit David; Holger Gohlke; Jörg PietruszkaChemical Science Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IBG-1, IBI-7, IBOC 9.3.2025

C. Datenpublikationen (teilweise auch Software)

Hierzu zählen Publikationen, die in JuSER verzeichnet sind.

Fehlende POF-Zuordnungen muss man in JuSER nachtragen.

Da auf Jülich DATA bislang noch nicht zwischen Daten- und Software-Publikationen unterschieden wird, wird hier teilweise auch Software verzeichnet. Das ist aktuell für das Berichtswesen noch nicht kritisch und wird ab dem nächsten Jahr vermieden.

Anzahl zählbare Publikationen: 0

TitelAutorenPOFandere Institutezuletzt geändert
Resolving dynamics and function of transient states in single enzyme molecules - Dataset for T26E functional mutantHemmen, Katherina; Seidel, Claus; Sanabria, Hugo; Hubbell, Wayne; Thomas-Otavio Peulen; Holger Gohlke; Dimura, Mykola Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IHRS-BioSoft 9.3.2025
Resolving dynamics and function of transient states in single enzyme molecules - Dataset for T26E functional mutantHemmen, Katherina; Seidel, Claus; Sanabria, Hugo; Hubbell, Wayne; Thomas-Otavio Peulen; Holger Gohlke; Dimura, Mykola Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IHRS-BioSoft 9.3.2025
Resolving dynamics and function of transient states in single enzyme molecules - Dataset for E11A functional mutantHemmen, Katherina; Seidel, Claus; Sanabria, Hugo; Hubbell, Wayne; Thomas-Otavio Peulen; Holger Gohlke; Dimura, Mykola Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IHRS-BioSoft 9.3.2025
Resolving dynamics and function of transient states in single enzyme molecules - Dataset for E11A functional mutantHemmen, Katherina; Seidel, Claus; Sanabria, Hugo; Hubbell, Wayne; Thomas-Otavio Peulen; Holger Gohlke; Dimura, Mykola Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! IHRS-BioSoft 9.3.2025
Software Quality Indicators: extraction, categorisation and recommendations from canonical sourcesMartin del Pico, Eva; Psomopoulos, Fotis; Portell Silva, Laura; Alves, Renato; Moretti, Sébastien; Sufi, Shoaib; Bouhraoua, Kamel Eddine Adel; Steinberg, David; Farrell, Gavin; Tsontaki, Maria; Andrade Buono, Rafael; Sebastian Beier; Garijo, Daniel; Fernández González, José María; Steeghs-Turchina, Mariia; Mihail, Anton Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 9.3.2025
Software Quality Indicators: extraction, categorisation and recommendations from canonical sourcesMartin del Pico, Eva; Psomopoulos, Fotis; Portell Silva, Laura; Alves, Renato; Moretti, Sébastien; Sufi, Shoaib; Bouhraoua, Kamel Eddine Adel; Steinberg, David; Farrell, Gavin; Tsontaki, Maria; Andrade Buono, Rafael; Sebastian Beier; Garijo, Daniel; Fernández González, José María; Steeghs-Turchina, Mariia; Mihail, Anton Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 9.3.2025
Software Quality Indicators: extraction, categorisation and recommendations from canonical sourcesMartin del Pico, Eva; Psomopoulos, Fotis; Portell Silva, Laura; Alves, Renato; Moretti, Sébastien; Sufi, Shoaib; Bouhraoua, Kamel Eddine Adel; Steinberg, David; Farrell, Gavin; Tsontaki, Maria; Andrade Buono, Rafael; Sebastian Beier; Garijo, Daniel; Fernández González, José María; Steeghs-Turchina, Mariia; Mihail, Anton Nicht in JuSER oder ohne POF; würde nicht gezählt! 9.3.2025

D. Software-Publikationen

Hierzu zählen Publikationen, die in JuSER verzeichnet sind.

Fehlende POF-Zuordnungen muss man in JuSER nachtragen.

Anzahl zählbare Publikationen: 0

TitelAutorenPOFandere Institutezuletzt geändert
keine