← Zurück zur Institutsliste

Inst Reports – Überblick über Publikationen der/des IBG-4 für das Berichtsjahr 2022

Diese Seite wird zu jeder vollen Stunde aktualisiert. Sie können diesen Link in Ihre Bookmarks übernehmen.

Inhalt

Die Publikationen in den Abschnitten A und B sind alle Text-Publikationen, die für die Programmberichte bzw. den Zentrenfortschrittsbericht für das Jahr 2022 gemeldet werden. Diese Liste kann nicht mehr geändert werden. Jülicher Autoren sind fett gedruckt.

Die Publikationsliste dieses Berichtes gibt es auch als ODS-Datei, allerdings ist nur die aktuelle Webseite verbindlich für das Berichtswesen.

Diese Seite ist ein Dienst der ZB. Fragen können Sie richten an: juser@fz-juelich.de

Der Quellcode, der diesen Bericht erstellt, ist frei verfügbar.

A. ISI/Scopus-referierte Publikationen

Hierzu zählen Publikationen in Journals, die entweder in der Master Journal List „Web of Science Core Collection“ von Clarivate Analytics oder in der „Scopus Source List“ von Elsevier gelistet sind.

Anzahl zählbare Publikationen: 38

TitelAutorenJournal/KonferenzPOFandere Institutezuletzt geändert
A manually curated compendium of expression profiles for the microbial cell factory Corynebacterium glutamicumKranz, Angela; Polen, Tino; Kotulla, Christian; Arndt, Annette; Bosco, Graziella; Bussmann, Michael; Chattopadhyay, Ava; Cramer, Annette; Davoudi, Cedric-Farhad; Degner, Ursula; Diesveld, Ramon; Freiherr von Boeselager, Raphael; Gärtner, Kim; Gätgens, Cornelia; Georgi, Tobias; Geraths, Christian; Haas, Sabine; Heyer, Antonia; Hünnefeld, Max; Ishige, Takeru; Kabus, Armin; Kallscheuer, Nicolai; Kever, Larissa; Klaffl, Simon; Kleine, Britta; Kočan, Martina; Koch-Koerfges, Abigail; Kraxner, Kim J.; Krug, Andreas; Krüger, Aileen; Küberl, Andreas; Labib, Mohamed; Lange, Christian; Mack, Christina; Maeda, Tomoya; Mahr, Regina; Majda, Stephan; Michel, Andrea; Morosov, Xenia; Müller, Olga; Nanda, Arun M.; Nickel, Jens; Pahlke, Jennifer; Pfeifer, Eugen; Platzen, Laura; Ramp, Paul; Rittmann, Doris; Schaffer, Steffen; Scheele, Sandra; Spelberg, Stephanie; Schulte, Julia; Schweitzer, Jens-Eric; Sindelar, Georg; Sorger-Herrmann, Ulrike; Spelberg, Markus; Stansen, Corinna; Tharmasothirajan, Apilaasha; Ooyen, Jan van; van Summeren, Philana; Vogt, Michael; Witthoff, Sabrina; Zhu, Lingfeng; Eikmanns, Bernhard J.; Oldiges, Marco; Schaumann, Georg; Baumgart, Meike; Brocker, Melanie; Eggeling, Lothar; Freudl, Roland; Frunzke, Julia; Marienhagen, Jan; Wendisch, Volker F.; Bott, MichaelScientific data 2171 IBG-1 22.2.2023
Structure and function of redox-sensitive superfolder green fluorescent protein variantHeimsch, Kim; Gertzen, Christoph G. W.; Schuh, Katharina; Nietzel, Thomas; Rahlfs, Stefan; Przyborski, Jude; Gohlke, Holger; Schwarzländer, Markus; Becker, Katja; Fritz-Wolf, KarinAntioxidants & redox signaling 2171, 2172, 5111, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
A MademoiseLLE domain binding platform links the key RNA transporter to endosomesDevan, Senthil-Kumar; Schott-Verdugo, Stephan; Müntjes, Kira; Bismar, Lilli; Reiners, Jens; Hachani, Eymen; Schmitt, Lutz; Höppner, Astrid; Smits, Sander HJ; Gohlke, Holger; Feldbrügge, MichaelPLoS Genetics 5111, 2171, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
Uncoupling of Voltage- and Ligand-Induced Activation in HCN2 Channels by Glycine InsertsYüksel, Sezin; Bonus, Michele; Schwabe, Tina; Pfleger, Christopher; Zimmer, Thomas; Enke, Uta; Saß, Inga; Gohlke, Holger; Benndorf, Klaus; Kusch, JanaFrontiers in physiology 5111, 2171, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
Rational Design Yields Molecular Insights on Leaf-Binding of Anchor PeptidesDittrich, Jonas; Brethauer, Christin; Goncharenko, Liudmyla; Bührmann, Jens; Zeisler-Diehl, Viktoria; Pariyar, Shyam; Jakob, Felix; Kurkina, Tetiana; Schreiber, Lukas; Schwaneberg, Ulrich; Gohlke, HolgerACS applied materials & interfaces 5111, 2171, 2172, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
Single MHC‐I Expression Promotes Virus‐Induced Liver ImmunopathologyXu, Haifeng C.; Huang, Jun; Pandyra, Aleksandra A.; Pandey, Piyush; Wang, Ruifeng; Zhang, Zeli; Zhuang, Yuan; Gertzen, Christoph G. W.; Münk, Carsten; Herebian, Diran; Borkhardt, Arndt; Recher, Mike; Gohlke, Holger; Esposito, Irene; Oberbarnscheidt, Martin; Häussinger, Dieter; Lang, Karl S.; Lang, Philipp A.Hepatology communications 5111, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
Development of a First-in-Class Small-Molecule Inhibitor of the C-Terminal Hsp90 DimerizationBhatia, Sanil; Spanier, Lukas; Bickel, David; Dienstbier, Niklas; Woloschin, Vitalij; Vogt, Melina; Pols, Henrik; Lungerich, Beate; Reiners, Jens; Aghaallaei, Narges; Diedrich, Daniela; Frieg, Benedikt; Schliehe-Diecks, Julian; Bopp, Bertan; Lang, Franziska; Gopalswamy, Mohanraj; Loschwitz, Jennifer; Bajohgli, Baubak; Skokowa, Julia; Borkhardt, Arndt; Hauer, Julia; Hansen, Finn K.; Smits, Sander H. J.; Jose, Joachim; Gohlke, Holger; Kurz, ThomasACS central science 5111, 2171, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
Functional and structural characterization of interactions between opposite subunits in HCN pacemaker channelsKondapuram, Mahesh; Frieg, Benedikt; Yüksel, Sezin; Schwabe, Tina; Sattler, Christian; Lelle, Marco; Schweinitz, Andrea; Schmauder, Ralf; Benndorf, Klaus; Gohlke, Holger; Kusch, JanaCommunications biology 5111, 2171, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
Recurrent Germline Variant in RAD21 Predisposes Children to Lymphoblastic Leukemia or LymphomaSchedel, Anne; Friedrich, Ulrike Anne; Morcos, Mina N. F.; Wagener, Rabea; Mehtonen, Juha; Watrin, Titus; Saitta, Claudia; Brozou, Triantafyllia; Michler, Pia; Walter, Carolin; Försti, Asta; Baksi, Arka; Menzel, Maria; Horak, Peter; Paramasivam, Nagarajan; Fazio, Grazia; Autry, Robert J; Fröhling, Stefan; Suttorp, Meinolf; Gertzen, Christoph; Gohlke, Holger; Bhatia, Sanil; Wadt, Karin; Schmiegelow, Kjeld; Dugas, Martin; Richter, Daniela; Glimm, Hanno; Heinäniemi, Merja; Jessberger, Rolf; Cazzaniga, Gianni; Borkhardt, Arndt; Hauer, Julia; Auer, FranziskaInternational journal of molecular sciences 5111, 2171, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
Mapping the helix arrangement of the reconstituted ETR1 ethylene receptor transmembrane domain by EPR spectroscopyKugele, Anandi; Uzun, Buket; Müller, Lena; Schott-Verdugo, Stephan; Gohlke, Holger; Groth, Georg; Drescher, MalteRSC Advances 5111, 2171, 2172, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
A phospholipase B from Pseudomonas aeruginosa with activity towards endogenous phospholipids affects biofilm assemblyWeiler, Andrea J.; Spitz, Olivia; Gudzuhn, Mirja; Schott, Stephan; Kamel, Michael; Thiele, Björn; Streit, Wolfgang R.; Kedrov, Alexej; Schmitt, Lutz; Gohlke, Holger; Kovacic, FilipBiochimica et biophysica acta / Molecular and cell biology of lipids 2171, 2172, 5111, 5241 IBG-2, IBI-7, IMET, JSC 27.1.2023
Respiratory and C4-photosynthetic NAD-malic enzyme coexist in bundle sheath cell mitochondria and evolved via association of differentially adapted subunitsHüdig, Meike; Tronconi, Marcos A; Zubimendi, Juan P; Sage, Tammy L; Poschmann, Gereon; Bickel, David; Gohlke, Holger; Maurino, Veronica GThe plant cell 2171, 2172, 5111, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
Critical Assessment of Structure-based Approaches to Improve Protein Resistance in Aqueous Ionic Liquids by Enzyme-wide Saturation MutagenesisEl Harrar, Till; Davari, Mehdi D.; Jaeger, Karl-Erich; Schwaneberg, Ulrich; Gohlke, HolgerComputational and structural biotechnology journal 2171, 2172, 5111, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
Unsaturated fatty acids augment protein transport via the SecA:SecYEG transloconKamel, Michael; Löwe, Maryna; Schott-Verdugo, Stephan; Gohlke, Holger; Kedrov, AlexejThe FEBS journal 5111, 2171, 2172, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
Biophysical and pharmacokinetic characterization of a small-molecule inhibitor of RUNX1/ETO tetramerization with anti-leukemic effectsGopalswamy, Mohanraj; Kroeger, Tobias; Bickel, David; Frieg, Benedikt; Akter, Shahina; Schott-Verdugo, Stephan; Viegas, Aldino; Pauly, Thomas; Mayer, Manuela; Przibilla, Julia; Reiners, Jens; Nagel-Steger, Luitgard; Smits, Sander H. J.; Groth, Georg; Etzkorn, Manuel; Gohlke, HolgerScientific reports 5111, 2171, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
Total Synthesis of the Antimycobacterial Natural Product Chlorflavonin and Analogs via a Late-Stage Ruthenium(II)-Catalyzed ortho-C(sp2)-H-HydroxylationBerger, Alexander; Knak, Talea; Kiffe-Delf, Anna-Lene; Mudrovcic, Korana; Singh, Vinayak; Njoroge, Mathew; Burckhardt, Bjoern B.; Gopalswamy, Mohanraj; Lungerich, Beate; Ackermann, Lutz; Gohlke, Holger; Chibale, Kelly; Kalscheuer, Rainer; Kurz, ThomasPharmaceuticals 5111, 2171, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
Protein engineering for feedback resistance in 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthaseJayaraman, Kumaresan; Trachtmann, Natalia; Sprenger, Georg A.; Gohlke, HolgerApplied microbiology and biotechnology 5111, 2171, 2172, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
Vasor: Accurate prediction of variant effects for amino acid substitutions in multidrug resistance protein 3Behrendt, Annika; Golchin, Pegah; König, Filip; Mulnaes, Daniel; Stalke, Amelie; Dröge, Carola; Keitel, Verena; Gohlke, HolgerHepatology communications 5111, 2171, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
Physiological, Biochemical, and Structural Bioinformatic Analysis of the Multiple Inositol Dehydrogenases from Corynebacterium glutamicumRamp, Paul; Pfleger, Christopher; Dittrich, Jonas; Mack, Christina; Gohlke, Holger; Bott, MichaelMicrobiology spectrum 5111, 2171, 2172, 5241 IBG-1, IBI-7, JSC 27.1.2023
Identification and Characterization of the Haloperoxidase VPO-RR from Rhodoplanes roseus by Genome Mining and Structure-Based Catalytic Site MappingPorta, Nicola; Fejzagić, Alexander Veljko; Dumschott, Kathryn; Paschold, Beatrix; Usadel, Björn; Pietruszka, Jörg; Classen, Thomas; Gohlke, HolgerCatalysts 2171, 5111, 5241 IBG-1, IBI-7, IBOC, JSC 27.1.2023
Spectroscopic and QM/MM studies of the Cu(I) binding site of the plant ethylene receptor ETR1Cutsail, George; Schott-Verdugo, Stephan; Müller, Lena; DeBeer, Serena; Groth, Georg; Gohlke, HolgerBiophysical journal 5111, 2171, 5241 IBI-7, JSC 27.1.2023
Met/Val129 polymorphism of the full-length human prion protein dictates distinct pathways of amyloid formationPauly, Thomas; Bolakhrif, Najoua; Kaiser, Jesko; Nagel-Steger, Luitgard; Gremer, Lothar; Gohlke, Holger; Willbold, DieterThe journal of biological chemistry 5111, 2171, 5244 IBI-7, JSC 27.1.2023
Enzymatic C3-Methylation of Indoles Using Methyltransferase PsmD─Crystal Structure, Catalytic Mechanism, and Preparative ApplicationsAmariei, Diana A.; Pozhydaieva, Nadiia; David, Benoit; Schneider, Pascal; Classen, Thomas; Gohlke, Holger; Weiergräber, Oliver H.; Pietruszka, JörgACS catalysis 2171, 5241 IBG-1, IBI-7, IBOC 23.1.2023
Insights into breeding history, hotspot regions of selection, and untapped allelic diversity for bread wheat breedingLehnert, Heike; Berner, Thomas; Lang, Daniel; Beier, Sebastian; Stein, Nils; Himmelbach, Axel; Kilian, Benjamin; Keilwagen, JensThe plant journal 2171 19.1.2023
Recommendations for the formatting of Variant Call Format (VCF) files to make plant genotyping data FAIRBeier, Sebastian; Fiebig, Anne; Pommier, Cyril; Liyanage, Isuru; Lange, Matthias; Kersey, Paul J.; Weise, Stephan; Finkers, Richard; Koylass, Baron; Cezard, Timothee; Courtot, Mélanie; Contreras-Moreira, Bruno; Naamati, Guy; Dyer, Sarah; Scholz, UweF1000Research 2171 9.1.2023
Towards smart and sustainable development of modern berry cultivars in EuropeSenger, Elisa; Osorio, Sonia; Olbricht, Klaus; Shaw, Paul; Denoyes, Béatrice; Davik, Jahn; Predieri, Stefano; Karhu, Saila; Raubach, Sebastian; Lippi, Nico; Höfer, Monika; Cockerton, Helen; Pradal, Christophe; Kafkas, Ebru; Litthauer, Suzanne; Amaya, Iraida; Usadel, Björn; Mezzetti, BrunoThe plant journal 2171 23.12.2022
A chromosome scale tomato genome built from complementary PacBio and Nanopore sequences alone reveals extensive linkage drag during breedingRengs, Willem M. J.; Schmidt, Maximilian; Effgen, Sieglinde; Le, Duyen Bao; Wang, Yazhong; Zaidan, Mohd Waznul Adly Mohd; Huettel, Bruno; Schouten, Henk J.; Usadel, Björn; Underwood, Charles J.The plant journal 2171 22.12.2022
Solanaceae pangenomes are coming of graphical age to bring heritability backUsadel, BjörnaBiotech 2171 22.12.2022
Genetic polyploid phasing from low-depth progeny samplesSchrinner, Sven; Serra Mari, Rebecca; Finkers, Richard; Arens, Paul; Usadel, Björn; Marschall, Tobias; Klau, Gunnar W.iScience 2171 22.12.2022
A Solanum lycopersicoides reference genome facilitates insights into tomato specialized metabolism and immunityPowell, Adrian F.; Feder, Ari; Li, Jie; Schmidt, Maximilian; Courtney, Lance; Alseekh, Saleh; Jobson, Emma M.; Vogel, Alexander; Xu, Yimin; Lyon, David; Dumschott, Kathryn; McHale, Marcus; Sulpice, Ronan; Bao, Kan; Lal, Rohit; Duhan, Asha; Hallab, Asis; Denton, Alisandra K.; Bolger, Marie E.; Fernie, Alisdair R.; Hind, Sarah R.; Mueller, Lukas A.; Martin, Gregory B.; Fei, Zhangjun; Martin, Cathie; Giovannoni, James J.; Strickler, Susan R.; Usadel, BjörnThe plant journal 2171 22.12.2022
Cold and exogenous calcium alter Allium fistulosum cell wall pectin to depress intracellular freezing temperaturesLiu, Jun; Willick, Ian R; Hiraki, Hayato; Forand, Ariana D; Lawrence, John R; Swerhone, George D W; Wei, Yangdou; Ghosh, Supratim; Lee, Sohyeon; Olsen, Jorunn E; Usadel, Björn; Wormit, Alexandra; Günl, Markus; Karunakaran, Chithra; Dynes, James J; Tanino, Karen KThe journal of experimental botany 2171 IBG-2 22.12.2022
Structural, mechanistic and physiological insights into phospholipase A-mediated membrane phospholipid degradation in Pseudomonas aeruginosaBleffert, Florian; Granzin, Joachim; Caliskan, Muttalip; Schott-Verdugo, Stephan N; Siebers, Meike; Thiele, Björn; Rahme, Laurence G; Felgner, Sebastian; Dörmann, Peter; Gohlke, Holger; Batra-Safferling, Renu; Jaeger, Karl-Erich; Kovacic, FilipeLife 5111, 2171, 5241 IBG-2, IBI-7, IMET, JSC 10.8.2022
Capsicum Leaves under Stress: Using Multi-Omics Analysis to Detect Abiotic Stress Network of Secondary Metabolism in Two SpeciesReimer, Julia Jessica; Shaaban, Basel; Drummen, Noud; Sanjeev Ambady, Sruthy; Genzel, Franziska; Poschet, Gernot; Wiese-Klinkenberg, Anika; Usadel, Björn; Wormit, AlexandraAntioxidants 2171 26.4.2022
Ancient Artworks and Crocus Genetics Both Support Saffron’s Origin in Early GreeceKazemi-Shahandashti, Seyyedeh-Sanam; Mann, Ludwig; El-nagish, Abdullah; Harpke, Dörte; Nemati, Zahra; Usadel, Björn; Heitkam, TonyFrontiers in plant science 2171 26.4.2022
GXP: Analyze and Plot Plant Omics Data in Web BrowsersEiteneuer, Constantin; Velasco, David; Atemia, Joseph; Wang, Dan; Schwacke, Rainer; Wahl, Vanessa; Schrader, Andrea; Reimer, Julia J.; Fahrner, Sven; Pieruschka, Roland; Schurr, Ulrich; Usadel, Björn; Hallab, AsisPlants 2171 IBG-2 6.4.2022
Phased, chromosome-scale genome assemblies of tetraploid potato reveals a complex genome, transcriptome, and predicted proteome landscape underpinning genetic diversityHoopes, Genevieve; Meng, Xiaoxi; Hamilton, John P.; Achakkagari, Sai Reddy; de Alves Freitas Guesdes, Fernanda; Bolger, Marie E.; Coombs, Joseph J.; Esselink, Danny; Kaiser, Natalie R.; Kodde, Linda; Kyriakidou, Maria; Lavrijssen, Brian; van Lieshout, Natascha; Shereda, Rachel; Tuttle, Heather K.; Vaillancourt, Brieanne; Wood, Joshua C.; de Boer, Jan M.; Bornowski, Nolan; Bourke, Peter; Douches, David; van Eck, Herman J.; Ellis, Dave; Feldman, Max J.; Gardner, Kyle M.; Hopman, Johannes C. P.; Jiang, Jiming; De Jong, Walter S.; Kuhl, Joseph C.; Novy, Richard G.; Oome, Stan; Sathuvalli, Vidyasagar; Tan, Ek Han; Ursum, Remco A.; Vales, M. Isabel; Vining, Kelly; Visser, Richard G. F.; Vossen, Jack; Yencho, G. Craig; Anglin, Noelle L.; Bachem, Christian W. B.; Endelman, Jeffrey B.; Shannon, Laura M.; Strömvik, Martina V.; Tai, Helen H.; Usadel, Björn; Buell, C. Robin; Finkers, RichardMolecular plant 2171 28.3.2022
Time-resolved structural analysis of an RNA-cleaving DNA catalystBorggräfe, Jan; Victor, Julian; Rosenbach, Hannah; Viegas, Aldino; Gertzen, Christoph G. W.; Wuebben, Christine; Kovacs, Helena; Gopalswamy, Mohanraj; Riesner, Detlev; Steger, Gerhard; Schiemann, Olav; Gohlke, Holger; Span, Ingrid; Etzkorn, ManuelNature <London> 5111, 2171, 2172, 5244 IBI-7, JSC 17.2.2022
Morphological and Physiological Traits Associated with Yield under Reduced Irrigation in Chilean Coastal Lowland QuinoaDumschott, Kathryn; Wuyts, Nathalie; Alfaro, Christian; Castillo, Dalma; Fiorani, Fabio; Zurita-Silva, AndrésPlants 2171 IBG-2 26.1.2022

B. Andere referierte Publikationen

Hierzu zählen Publikationen in Journals, die nicht unter (A) fallen. Die Vergabe einer DOI ist zwingende Voraussetzung. Sonderfall Erde und Umwelt: Hier zählen einschließlich Bücher und Buchkapitel.

Anzahl zählbare Publikationen: 1

TitelAutorenJournal/KonferenzPOFandere Institutezuletzt geändert
Crop genetic diversity uncovers metabolites, elements, and gene networks predicted to be associated with high plant biomass yields in maizeHajheidari, Mohsen; Gerlach, Nina; Dorau, Kristof; Omidbakhshfard, M Amin; Pesch, Lina; Hofmann, Jörg; Hallab, Asis; Ponce-Soto, Gabriel Y; Kuhalskaya, Anastasiya; Medeiros, David B; Bourceret, Amélia; Usadel, Björn; Mayer, Jochen; Fernie, Alisdair; Mansfeldt, Tim; Sonnewald, Uwe; Bucher, MarcelPNAS nexus 2171 23.12.2022

C. Datenpublikationen

Hierzu zählen Publikationen, die in Jülich DATA verzeichnet sind.

Fehlende POF-Zuordnungen muss man in Jülich DATA nachtragen. Bitte beachten Sie, dass diese Nachtragungen dann aber erst für das folgende Berichtsjahr gewertet werden, weil die Deadline für 2022 bereits verstrichen ist.

Anzahl zählbare Publikationen: 0

TitelAutorenPOFandere Institutezuletzt geändert
Genome assembly of a commercial tomato hybrid (Funtelle) for haplotyping an introgression that confers TMV resistanceBjörn Usadel Keine POF gefunden; wurde nicht gezählt! 30.3.2023

C. Software-Publikationen

Hierzu zählen Publikationen, die in Jülich DATA verzeichnet sind.

Fehlende POF-Zuordnungen muss man in Jülich DATA nachtragen. Bitte beachten Sie, dass diese Nachtragungen dann aber erst für das folgende Berichtsjahr gewertet werden, weil die Deadline für 2022 bereits verstrichen ist.

Anzahl zählbare Publikationen: 0

TitelAutorenPOFandere Institutezuletzt geändert
keine