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Inst Reports – Überblick über Publikationen der/des IBI-7 für das Berichtsjahr 2023

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Inhalt

Die Publikationen in den Abschnitten A und B sind alle Text-Publikationen, die für die Programmberichte bzw. den Zentrenfortschrittsbericht für das Jahr 2023 gemeldet werden. Diese Liste kann nicht mehr geändert werden. Jülicher Autoren sind fett gedruckt.

Die Publikationsliste dieses Berichtes gibt es auch als ODS-Datei, allerdings ist nur die aktuelle Webseite verbindlich für das Berichtswesen.

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A. ISI/Scopus-referierte Publikationen

Hierzu zählen Publikationen in Journals, die entweder in der Master Journal List „Web of Science Core Collection“ von Clarivate Analytics oder in der „Scopus Source List“ von Elsevier gelistet sind.

Anzahl zählbare Publikationen: 46

TitelAutorenJournal/KonferenzPOFandere Institutezuletzt geändert
The architecture of the 10‐23 DNA zyme and its implications for DNA ‐mediated catalysisBorggräfe, Jan; Gertzen, Christoph G. W.; Viegas, Aldino; Gohlke, Holger; Etzkorn, ManuelThe FEBS journal 2171; 5241 IBG-4 2.5.2024
Evaluation of the 18F-Labeled Analog of the Therapeutic All-d-enantiomeric Peptide RD2 for Amyloid β ImagingShah, N. Jon; Burda, Nicole; Kutzsche, Janine; Willbold, Dieter; Gering, Ian; Langen, Karl-Josef; Schöneck, Michael; Neumaier, Bernd; Drzezga, Alexander; Willuweit, Antje; Humpert, Swen; Endepols, Heike; Gremer, LotharEuropean journal of pharmaceutical sciences 5253; 5244; 5252 INM-4, INM-5, INM-2, INM-11, JARA-BRAIN, JARA-BRAIN 8.4.2024
Fibril core regions in engineered α-synuclein dimer are crucial for blocking of fibril elongationSchulz, Celina M.; Pfitzer, Anne; Hoyer, WolfgangBBA advances 5241 21.2.2024
Patients with isolated REM-sleep behavior disorder have elevated levels of alpha-synuclein aggregates in stoolSchleyken, Sophia; Pils, Marlene; Willbold, Dieter; Barbe, Michael T.; Schaffrath, Anja; Willbold, Johannes; Fink, Gereon R.; Özdüzenciler, Pelin; Seger, Aline; Cousin, Anneliese; Sommerauer, Michael; Tamgüney, Gültekin; Jergas, Hannah; Blömeke, Lara; Bannach, Oliver; Bujnicki, Tuyennpj Parkinson's Disease 5244 INM-3 29.1.2024
Integrative modeling of guanylate binding protein dimersSchumann, Wibke; Stühler, Kai; Poschmann, Gereon; Smits, Sander H. J.; Strodel, Birgit; Loschwitz, Jennifer; Pfeffer, Klaus; Reiners, Jens; Degrandi, Daniel; Legewie, LarissaProtein science 5241 24.1.2024
Functional reconstitution and structural characterization of the plant hormone receptor ETR1 in lipid nanodiscsLakomek, Nils; Groth, Georg; Lemke, Moritz; Reiners, Jens; Smits, Sander H. J.Chemical communications 5241 22.1.2024
Sub-millisecond conformational dynamics of the A2A adenosine receptor revealed by single-molecule FRETGordeliy, Valentin; Gensch, Thomas; Maslov, Ivan; Volkov, Oleksandr; Hendrix, Jelle; Luginina, Aleksandra; Cherezov, Vadim; Coucke, Quinten; Kuzmichev, Pavel; Mishin, Alexey; Bogorodskiy, Andrey; Khorn, Polina; Hofkens, Johan; Wanninger, Simon; Barth, Anders; Borshchevskiy, Valentin; Gusach, Anastasiia; Orekhov, Philipp; Gerasimov, AndreyCommunications biology 5244 IBI-1 22.1.2024
Disrupted‐in‐schizophrenia 1 protein aggregates in cerebrospinal fluid are elevated in patients with first‐episode psychosisPiehl, Fredrik; Eren, Feride; Sellgren, Carl; Cervenka, Simon; Troßbach, Svenja; Willbold, Dieter; Erhardt, Sophie; Pils, Marlene; Rutsch, Julia; Engberg, Göran; Korth, Carsten; Bannach, OliverPsychiatry and clinical neurosciences 5244 18.1.2024
Tau protein aggregation associated with SARS-CoV-2 main proteaseBannach, Oliver; Eberle, Raphael Josef; Sommerhage, Simon; Willbold, Dieter; Coronado, Mônika Aparecida; Gering, Ian; Korostov, Karolina; Kraemer-Schulien, Victoria; Stefanski, Anja; Stühler, Kai; Blömeke, LaraPLOS ONE 5244 18.1.2024
The Avidity of Autoreactive Alpha-Synuclein Antibodies in Leucine-Rich Repeat Kinase 2 Mutation Carriers Is Not Altered Compared to Healthy Controls or Patients with Parkinson’s DiseaseRoss, Jean Alexander; Albus, Alexandra; Kronimus, Yannick; Burg-Roderfeld, Monika; van der Wurp, Hendrik; Willbold, Dieter; Ziehm, Tamar; Dodel, RichardBiomolecules 5244 18.1.2024
Cryo-EM of Aβ Fibrils from Mouse Models find tg-APPArcSwe fibrils resemble those found in sporadic Alzheimer's disease patientsIngelsson, Martin; Peralta Reyes, Fernanda; Donner, Lili; Willbold, Dieter; Willuweit, Antje; Syvänen, Stina; Sehlin, Dag; Schäfer, Luisa; Schröder, Gunnar; Zielinski, Mara; Elvers, Margitta; Frieg, Benedikt; Gremer, Lothar; Nilsson, Lars N. G.; Schemmert, SarahNature neuroscience 5244 18.1.2024
Development and implementation of an internal quality control sample to standardize oligomer-based diagnostics of Alzheimer's diseasePils, Marlene; Hoyer, Wolfgang; Riesner, Detlev; Kraemer-Schulien, Victoria Maria; Rehn, Fabian; Bujnicki, Tuyen; Willbold, Dieter; Blömeke, Lara; Dybala, Alexandra; Bannach, OliverDiagnostics 5244 18.1.2024
Differentiation of subnucleus-sized oligomers and nucleation-competent assemblies of the A β peptideZhang, Tao; Sternke-Hoffmann, Rebecca; Nagel-Steger, Luitgard; Willbold, Dieter; Pauly, ThomasBiophysical journal 5244 18.1.2024
Amyloid fibril formation kinetics of low-pH denatured bovine PI3K-SH3 monitored by three different NMR techniquesLakomek, Nils-Alexander; Gardon, Luis; Becker, Nina; Heise, Henrike; Hölbling, Christoph; Schulz, Celina M.; Bochinsky, Kevin; Gremer, Lothar; Rähse, Nick; Apostolidis, AthinaFrontiers in molecular biosciences 5241 11.1.2024
Sporadic Use of Antibiotics in Older Adults and the Risk of Dementia: A Nested Case–Control Study Based on German Health Claims DataDoblhammer, Gabriele; Rakuša, Elena; Fink, Anne; Tamgüney, Gültekin; Heneka, Michael T.Journal of Alzheimer's disease 5244 11.1.2024
Nucleation of α-Synuclein Amyloid Fibrils Induced by Cross-Interaction with β-Hairpin Peptides Derived from Immunoglobulin Light ChainsSchützmann, Marie P.; Schneider, Walfried; Stoldt, Matthias; Hoyer, Wolfgang; Heid, Laetitia F.; Kupreichyk, TatsianaInternational journal of molecular sciences 5241 11.1.2024
Amyloid oligomers as on-pathway precursors or off-pathway competitors of fibrilsMuschol, Martin; Hoyer, WolfgangFrontiers in molecular biosciences 5244 3.11.2023
Editorial: The biochemistry of amyloids in neurodegenerative diseases, volume IILuo, Jinghui; Gomes, Cláudio M.; Hoyer, WolfgangFrontiers in neuroscience 5244 2.11.2023
The role of heat shock proteins in preventing amyloid toxicityBoisbouvier, Jerome; Törner, Ricarda; Kupreichyk, Tatsiana; Hoyer, WolfgangFrontiers in molecular biosciences 5244 2.11.2023
Electroneutral Polymer Nanodiscs Enable Interference‐Free Probing of Membrane Proteins in a Lipid‐Bilayer EnvironmentGlueck, David; Das, Manabendra; Patallo, Eugenio Pérez; Mmeka, Ogochukwu Patricia; Bernhard, Frank; Victor, Julian; Rajender, Ritu; Grethen, Anne; Köck, Zoe; Chu, Ci; Vargas, Carolyn; Räschle, Markus; Keller, Sandro; Kins, Stefan; Meister, Annette; Babalola, Jonathan Oyebamiji; Etzkorn, ManuelSmall 5241 17.10.2023
Atomare Einblicke in die Dynamik der Membransysteme und der BiokatalyseEtzkorn, ManuelBiospektrum 5241 17.10.2023
Widespread amyloidogenicity potential of multiple myeloma patient-derived immunoglobulin light chainsEgelhaaf, Stefan U.; Hansen, Jan; Nagel-Steger, Luitgard; Haas, Rainer; Malosse, Christian; Fenk, Roland; Chamot-Rooke, Julia; Tucholski, Florian; Duchateau, Magalie; Norrild, Rasmus K.; Dupré, Mathieu; Platten, Florian; Buell, Alexander K.; Rey, Martial; Metzger, Sabine; Sternke-Hoffmann, Rebecca; Høie, Magnus Haraldson; Marcatili, Paolo; Boquoi, Amelie; Pauly, ThomasBMC biology 5241 IBI-4 13.10.2023
Combining skin and olfactory α-synuclein seed amplification assays (SAA)—towards biomarker-driven phenotyping in synucleinopathiesZimmermann, P. H.; Tamgüney, G.; Rak, K.; Kaulitz, S.; Klussmann, J. P.; Panzer, C.; Blaschke, S. J.; Hackenberg, S.; Doppler, K.; Seger, A.; Scherzad, A.; Musacchio, T.; Volkmann, J.; Sommerauer, Michael; Maltese, V.; Rößle, J.; Sommer, C.; Kuzkina, A.; Kohl, A.npj Parkinson's Disease 5252; 5244 INM-3 12.10.2023
Discovery of novel amino acid production traits by evolution of synthetic co-culturesPolen, Tino; Neuheuser, Friederike; Baumgart, Meike; Zuchowski, Rico; Menke, Philipp; Sundermeyer, Lea; Bott, Michael; Schito, Simone; Gujar, Srushti; Wirtz, Astrid; Mack, Christina; Weiergräber, Oliver H.; Hollmann, Niels; Noack, Stephan; Berger, DanielMicrobial cell factories 2171; 5241 IBG-1 9.10.2023
A Hairpin Motif in the Amyloid-β Peptide Is Important for Formation of Disease-Related OligomersGräslund, Astrid; Strodel, Birgit; Österlund, Nicklas; Khaled, Mohammed; Rönnbäck, Isabel; Ilag, Leopold L.Journal of the American Chemical Society 5241 29.9.2023
Domain motions, dimerization, and membrane interactions of the murine guanylate binding protein 2Steffens, Nora; Wang, Xue; Schäffler, Moritz; Pfeffer, Klaus; Degrandi, Daniel; Strodel, Birgit; Loschwitz, JenniferScientific reports 5241 28.9.2023
DNA-binding and protein structure of nuclear factors likely acting in genetic information processing in the Paulinella chromatophoreOberleitner, Linda; Macorano, Luis; Seyffert, Sarah; Gertzen, Christoph G. W.; Singer, Anna; Spiegl, Tobias; Klimenko, Victoria; Höppner, Astrid; Applegate, Violetta; Stefanski, Anja; Gremer, Lothar; Smits, Sander H. J.; Nowack, Eva C. M.; Binny, Taniya M.Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 5241 19.9.2023
Intrinsic Disorder of the Neuronal SNARE Protein SNAP25a in its Pre-fusion ConformationBiehl, Ralf; Gremer, Lothar; Pribicevic, Sonja; Vormann, Katharina; Pérez-Lara, Ángel; Jahn, Reinhard; Lakomek, Nils; Stief, Tobias; Espinueva, Delane F.Journal of molecular biology 6G4; 633; 5244 JCNS-1 19.9.2023
Oral treatment with the all-d-peptide RD2 enhances cognition in aged beagle dogs – A model of sporadic Alzheimer’s diseaseHalbgebauer, Steffen; Post, Julia; Schemmert, Sarah; Araujo, Joseph A.; Jürgens, Dagmar; Willbold, Dieter; Bannach, Oliver; Willuweit, Antje; Kraemer-Schulien, Victoria; Bujnicki, Tuyen; Kulawik, Andreas; Rossberg, Wolfgang M.; Otto, Markus; Blömeke, Lara; Kutzsche, Janine; Zafiu, Christian; Pils, Marlene; Hümpel, MichaelHeliyon 5244 19.9.2023
Combining structural and coevolution information to unveil allosteric sitesWissler, Lisa; Janet, Jon Paul; La Sala, Giuseppina; Gohlke, Holger; Käck, Helena; Schimpl, Marianne; Pfleger, Christopher; De Vivo, Marco; Frolov, Andrey I.; Nevin, Philip; Tyrchan, Christian; Hogner, Anders; Böhm, Kerstin; Stubbs, Christopher J.Chemical science 5111; 2171 I:(DE-Juel1)NIC-20090406, JSC, IBG-4 25.8.2023
Discovery of All- d -Peptide Inhibitors of SARS-CoV-2 3C-like ProteaseWillbold, Dieter; Eberle, Raphael J.; Sevenich, Marc; Santur, Karoline; Scharbert, Lara; Lakomek, Nils A.; Coronado, Mônika A.; Gering, Ian; Strodel, Birgit; Mohrlüder, JeannineACS chemical biology 5241 24.8.2023
Transition Networks Unveil Disorder-to-Order Transformations in Aβ Caused by Glycosaminoglycans or LipidsSchäffler, Moritz; Samantray, Suman; Strodel, BirgitInternational journal of molecular sciences 5241 11.7.2023
Residue alterations within a conserved hydrophobic pocket influence light, oxygen, voltage photoreceptor dark recoveryBatra-Safferling, Renu; Hemmer, Stefanie; Knieps-Grünhagen, Esther; Krauss, Ulrich; Willbold, Dieter; Jaeger, Karl-Erich; Panwalkar, Vineet; Granzin, Joachim; Schulte, MariannePhotochemical & photobiological sciences 5241 IBG-1, IMET 11.7.2023
Maturation of amyloid β fibrils alters their molecular stabilityBecker, Stefan; Giller, Karin; Sieme, Daniel; Rezaei-Ghaleh, NasrollahPhysical chemistry, chemical physics 5241 19.6.2023
Comparative molecular dynamics simulations of pathogenic and non-pathogenic huntingtin protein monomers and dimersSayyed-Ahmad, Abdallah; Khaled, Mohammed; Strodel, BirgitFrontiers in molecular biosciences 5241 19.6.2023
Oral Treatment with d-RD2RD2 Impedes Early Disease Mechanisms in SOD1*G93A Transgenic Mice but Does Not Prolong SurvivalWillbold, Dieter; Willuweit, Antje; Kutzsche, Janine; Wintz, Katharina; Post, Julia; Langen, Karl-JosefBiomedicines 5244 INM-4 17.5.2023
SEC14-GOLD protein PATELLIN2 binds IRON-REGULATED TRANSPORTER1 linking root iron uptake to vitamin EAngrand, Kalina; Hornbergs, Jannik; Stühler, Kai; Fink-Straube, Claudia; Ivanov, Rumen; Hartmann, Laura; Eutebach, Monique; Mohr, Inga; Strodel, Birgit; Bauer, Petra; Schnake, Anika; Brumbarova, Tzvetina; Loschwitz, Jennifer; Gratz, Regina; Montag, Karolin; Poschmann, Gereon; Zeier, JürgenPlant physiology 5241 16.5.2023
Fast Motions Dominate Dynamics of Intrinsically Disordered Tau Protein at High TemperaturesAbyzov, Anton; Mandelkow, Eckhard; Zweckstetter, Markus; Rezaie Ghaleh, NasrollahChemistry - a European journal 5241 28.3.2023
Stabilization of Monomeric Tau Protein by All D-Enantiomeric Peptide Ligands as Therapeutic Strategy for Alzheimer’s Disease and Other TauopathiesGering, Ian; Santiago-Schübel, Beatrix; Willbold, Dieter; Honold, Dominik; Schemmert, Sarah; Mohrlüder, Jeannine; Altendorf, Tim; Aghabashlou Saisan, Selma; Hoyer, Wolfgang; Tamgüney, Gültekin; Tusche, MarkusInternational journal of molecular sciences 5244 9.3.2023
The Importance of Epigallocatechin as a Scaffold for Drug Development against FlavivirusesCoronado, Mônika A.; Gering, Ian; Sevenich, Marc; Olivier, Danilo S.; Mastalipour, Mohammadamin; Amaral, Marcos S.; Willbold, Dieter; Eberle, Raphael J.Pharmaceutics 5241 7.3.2023
Atomic Resolution Insights into pH Shift Induced Deprotonation Events in LS-Shaped Aβ(1–42) Amyloid FibrilsGardon, Luis; Freiburg, Patrick; Neudecker, Philipp; Gremer, Lothar; Kupreichyk, Tatsiana; Heise, Henrike; Willbold, Dieter; Gohlke, Holger; Frieg, Benedikt; Becker, NinaJournal of the American Chemical Society 5111; 2171; 352; 5244 IBG-4, I:(DE-Juel1)NIC-20090406, JSC 21.2.2023
Familial Alzheimer’s Disease-Related Mutations Differentially Alter Stability of Amyloid-Beta AggregatesRezaei-Ghaleh, Nasrollah; Amininasab, Mehriar; Giller, Karin; Becker, StefanThe journal of physical chemistry letters 5241 9.2.2023
A novel binding site in the nicotinic acetylcholine receptor for MB327 can explain its allosteric modulation relevant for organophosphorus-poisoning treatmentBernauer, Tamara; Worek, Franz; Thiermann, Horst; Gohlke, Holger; Höfner, Georg; Paintner, Franz F.; Seeger, Thomas; Niessen, Karin V.; Wanner, Klaus T.; Kaiser, Jesko; Gertzen, Christoph G. W.Toxicology letters 5111; 5241 I:(DE-Juel1)NIC-20090406, JSC, IBG-4 1.2.2023
Ferritin self-assembly, structure, function, and biotechnological applicationsManukhov, Ilya V.; Murugova, Tatiana N.; Gushchin, Ivan Yu.; Vlasov, Alexey V.; Sudarev, Vsevolod V.; Kuklina, Daria D.; Dolotova, Sofya M.; Bukhalovich, Siarhei M.; Bazhenov, Sergey V.; Gordeliy, Valentin I.; Mikhailov, Anatolii E.; Rogachev, Andrey V.; Kuklin, Alexander I.; Osipov, Stepan D.; Ryzhykau, Yury L.; Uversky, Vladimir N.; Bondarev, Nikolay A.International journal of biological macromolecules 5241 31.1.2023
Editorial for the special issue “A Celebration of Women in Biophysical Chemistry”Kanelis, Voula; Lecomte, Sophie; Strodel, Birgit; Musselman, CatherineBiophysical chemistry 5241 13.1.2023
Cumulative Millisecond-Long Sampling for a Comprehensive Energetic Evaluation of Aqueous Ionic Liquid Effects on Amino Acid InteractionsEl Harrar, Till; Gohlke, HolgerJournal of chemical information and modeling 5111; 2171 IBG-4, I:(DE-Juel1)NIC-20090406, JSC 10.1.2023

B. Andere referierte Publikationen

Hierzu zählen Publikationen in Journals, die nicht unter (A) fallen. Die Vergabe einer DOI ist zwingende Voraussetzung. Sonderfall Erde und Umwelt: Hier zählen einschließlich Bücher und Buchkapitel.

Anzahl zählbare Publikationen: 0

TitelAutorenJournal/KonferenzPOFandere Institutezuletzt geändert
Thermodynamics of amyloid formationLuitgard Nagel-Steger; Dieter WillboldAlzheimer's & dementia Keine POF gefunden; wurde nicht gezählt! 8.5.2024
Blood‐based quantification of Aβ oligomers indicates impaired clearance from brain in ApoE ε4 positive subjectsTuyen Bujnicki; Oliver Bannach; Dieter Willbold; Lara Blömeke; Fabian Rehn; Marlene Pils; Victoria Maria Kraemer-Schulien; Janine KutzscheAlzheimer's & dementia Keine POF gefunden; wurde nicht gezählt! 8.5.2024
The purely thermodynamic anti-prionic mode of action for the treatment of neurodegenerative diseases - realized by target protein specific all-D-peptidesDieter WillboldBiophysical journal Keine POF gefunden; wurde nicht gezählt! 8.5.2024
Colonoscopy and Subsequent Risk of Parkinson’s DiseaseErdem Gültekin TamgüneyJournal of Parkinson's disease/Journal of Parkinson's disease (Online) Keine POF gefunden; wurde nicht gezählt! 8.5.2024
Rational design of structure‐based vaccines targeting misfolded alpha‐synuclein conformers of Parkinson's disease and related disordersErdem Gültekin TamgüneyBioengineering & translational medicine Keine POF gefunden; wurde nicht gezählt! 8.5.2024
Monitoring ligand-dependent conformational dynamics of a single G-protein-coupled receptor by time-resolved FRET in an ABEL trapThomas Gensch; Valentin Borshchevskiy Keine POF gefunden; wurde nicht gezählt! IBI-1 8.5.2024
Vaccination with structurally adapted fungal protein fibrils induces immunity to Parkinson’s diseaseBenedikt Frieg; Gunnar Schröder; Erdem Gültekin TamgüneyBrain Keine POF gefunden; wurde nicht gezählt! 8.5.2024
The purely thermodynamic anti-prionic mode of action for the treatment of neurodegenerative diseasesDieter WillboldBiophysical journal Keine POF gefunden; wurde nicht gezählt! 8.5.2024

C. Datenpublikationen

Hierzu zählen Publikationen, die in Jülich DATA verzeichnet sind.

Fehlende POF-Zuordnungen muss man in Jülich DATA nachtragen. Bitte beachten Sie, dass diese Nachtragungen dann aber erst für das folgende Berichtsjahr gewertet werden, weil die Deadline für 2023 bereits verstrichen ist.

Anzahl zählbare Publikationen: 0

TitelAutorenPOFandere Institutezuletzt geändert
keine

D. Software-Publikationen

Hierzu zählen Publikationen, die in Jülich DATA verzeichnet sind.

Fehlende POF-Zuordnungen muss man in Jülich DATA nachtragen. Bitte beachten Sie, dass diese Nachtragungen dann aber erst für das folgende Berichtsjahr gewertet werden, weil die Deadline für 2023 bereits verstrichen ist.

Anzahl zählbare Publikationen: 0

TitelAutorenPOFandere Institutezuletzt geändert
keine