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Die Publikationen in den Abschnitten A und B sind alle Text-Publikationen, die für die Programmberichte bzw. den Zentrenfortschrittsbericht für das Jahr 2022 gemeldet werden. Diese Liste kann nicht mehr geändert werden. Jülicher Autoren sind fett gedruckt.
Die Publikationsliste dieses Berichtes gibt es auch als ODS-Datei, allerdings ist nur die aktuelle Webseite verbindlich für das Berichtswesen.
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Hierzu zählen Publikationen in Journals, die entweder in der Master Journal List „Web of Science Core Collection“ von Clarivate Analytics oder in der „Scopus Source List“ von Elsevier gelistet sind.
Anzahl zählbare Publikationen: 28
| Titel | Autoren | Journal/Konferenz | POF | andere Institute | zuletzt geändert |
|---|---|---|---|---|---|
| Molecular Dynamics-Assisted Interpretation of Experimentally Determined Intrinsically Disordered Protein Conformational Components: The Case of Human α-Synuclein | Palomino-Hernandez, Oscar; Santambrogio, Carlo; Rossetti, Giulia; Fernandez, Claudio O.; Grandori, Rita; Carloni, Paolo | The journal of physical chemistry <Washington, DC> / B | 5241, 5111 | IAS-5, JSC | 21.3.2023 |
| Structure-Based Screening Reveals a Ligand That Stabilizes the [2Fe-2S] Clusters of Human mitoNEET and Reduces Ovarian Cancer Cell Proliferation | Marjault, Henri-Baptiste; Yang-Sung, Sohn; Zuo, Ke; Carloni, Paolo; Mittler, Ron; Nechushtai, Rachel | The journal of physical chemistry <Washington, DC> / B | 5241 | IAS-5 | 25.1.2023 |
| C-Graphs Tool with Graphical User Interface to Dissect Conserved Hydrogen-Bond Networks: Applications to Visual Rhodopsins | Bertalan, Éva; Lesca, Elena; Schertler, Gebhard F. X.; Bondar, Ana-Nicoleta | Journal of chemical information and modeling | 5241 | IAS-5 | 25.1.2023 |
| Preproteins couple the intrinsic dynamics of SecA to its ATPase cycle to translocate via a catch and release mechanism | Krishnamurthy, Srinath; Sardis, Marios-Frantzeskos; Eleftheriadis, Nikolaos; Chatzi, Katerina E.; Smit, Jochem H.; Karathanou, Konstantina; Gouridis, Giorgos; Portaliou, Athina G.; Bondar, Ana-Nicoleta; Karamanou, Spyridoula; Economou, Anastassios | Cell reports | 5241 | IAS-5 | 25.1.2023 |
| Algorithm to catalogue topologies of dynamic lipid hydrogen-bond networks | Karathanou, Konstantina; Bondar, Ana-Nicoleta | Biochimica et biophysica acta / Biomembranes | 5241 | IAS-5 | 25.1.2023 |
| Conserved hydrogen-bond motifs of membrane transporters and receptors | Lazaratos, Michalis; Siemers, Malte; Brown, Leonid S.; Bondar, Ana-Nicoleta | Biochimica et biophysica acta / Biomembranes | 5241 | IAS-5 | 24.1.2023 |
| Graphs of Hydrogen-Bond Networks to Dissect Protein Conformational Dynamics | Bondar, Ana-Nicoleta | The journal of physical chemistry <Washington, DC> / B | 5241 | IAS-5 | 24.1.2023 |
| Mechanisms of long-distance allosteric couplings in proton-binding membrane transporters | Bondar, Ana-Nicoleta | Advances in protein chemistry and structural biology | 5241 | IAS-5 | 24.1.2023 |
| Opioid Receptors and Protonation-Coupled Binding of Opioid Drugs | Lešnik, Samo; Bertalan, Éva; Bren, Urban; Bondar, Ana-Nicoleta | International journal of molecular sciences | 5241 | IAS-5 | 24.1.2023 |
| Proton Transfers to DNA in Native Electrospray Ionization Mass Spectrometry: A Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Study | Paulikat, Mirko; Aranda, Juan; Ippoliti, Emiliano; Orozco, Modesto; Carloni, Paolo | The journal of physical chemistry letters | 5241 | IAS-5 | 24.1.2023 |
| Aromaticity at position 39 in α‐synuclein: A modulator of amyloid fibril assembly and membrane‐bound conformations | Buratti, Fiamma A.; Boeffinger, Nicola; Garro, Hugo A.; Flores, Jesica S.; Hita, Francisco J.; Gonçalves, Phelippe do Carmo; Copello, Federico dos Reis; Lizarraga, Leonardo; Rossetti, Giulia; Carloni, Paolo; Zweckstetter, Markus; Outeiro, Tiago F.; Eimer, Stefan; Griesinger, Christian; Fernández, Claudio O. | Protein science | 5252, 5111 | IAS-5, INM-11, JSC | 24.1.2023 |
| Ligand based conformational space studies of the μ-opioid receptor | Sena, Diniz M.; Cong, Xiaojing; Giorgetti, Alejandro | Biochimica et biophysica acta / General subjects | 5241 | IAS-5 | 23.1.2023 |
| Nintedanib targets KIT D816V neoplastic cells derived from induced pluripotent stem cells of systemic mastocytosis | Toledo, Marcelo A. S.; Gatz, Malrun; Sontag, Stephanie; Gleixner, Karoline V.; Eisenwort, Gregor; Feldberg, Kristina; Hamouda, Ahmed E. I.; Kluge, Frederick; Guareschi, Riccardo; Rossetti, Giulia; Sechi, Antonio S.; Dufva, Olli M. J.; Mustjoki, Satu M.; Maurer, Angela; Schüler, Herdit M.; Goetzke, Roman; Braunschweig, Till; Kaiser, Anne; Panse, Jens; Jawhar, Mohamad; Reiter, Andreas; Hilberg, Frank; Ettmayer, Peter; Wagner, Wolfgang; Koschmieder, Steffen; Brümmendorf, Tim H.; Valent, Peter; Chatain, Nicolas; Zenke, Martin | Blood | 5111, 5241 | IAS-5, JSC | 16.1.2023 |
| Unveiling the G4-PAMAM capacity to bind and protect Ang-(1-7) bioactive peptide by molecular dynamics simulations | Chi, L. América; Asgharpour, Somayeh; Correa-Basurto, José; Bandala, Cindy Rodríguez; Martínez-Archundia, Marlet | Journal of computer aided molecular design | 5241 | IAS-5 | 15.11.2022 |
| Topological origin of the protein folding transition | Di Cairano, Loris; Capelli, Riccardo; Bel-Hadj-Aissa, Ghofrane; Pettini, Marco | Physical review / E | Keine POF gefunden; wurde nicht gezählt! | IAS-5 | 15.11.2022 |
| Interplay between local protein interactions and water bridging of a proton antenna carboxylate cluster | Bondar, Ana-Nicoleta | Biochimica et biophysica acta / Biomembranes | 5241 | IAS-5 | 14.11.2022 |
| Hydrogen-bond networks for proton couplings in G-Protein coupled receptors | Bondar, Ana-Nicoleta; Alfonso-Prieto, Mercedes | Frontiers in physics | 5241 | IAS-5 | 27.10.2022 |
| α-Synuclein phosphorylation at serine 129 occurs after initial protein deposition and inhibits seeded fibril formation and toxicity | Ghanem, Simona S.; Majbour, Nour K.; Vaikath, Nishant N.; Ardah, Mustafa T.; Erskine, Daniel; Jensen, Nanna Møller; Fayyad, Muneera; Sudhakaran, Indulekha P.; Vasili, Eftychia; Melachroinou, Katerina; Abdi, Ilham Y.; Poggiolini, Ilaria; Santos, Patricia; Dorn, Anton; Carloni, Paolo; Vekrellis, Kostas; Attems, Johannes; McKeith, Ian; Outeiro, Tiago F.; Jensen, Poul Henning; El-Agnaf, Omar M. A. | Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America | 5241 | IAS-5 | 27.10.2022 |
| On the derivation of a Nonlinear Generalized Langevin Equation | Di Cairano, Loris | Journal of physics communications | 5241 | IAS-5 | 27.10.2022 |
| Wavefunction-Based Electrostatic-Embedding QM/MM Using CFOUR through MiMiC | Kirsch, Till; Olsen, Jógvan Magnus Haugaard; Bolnykh, Viacheslav; Meloni, Simone; Ippoliti, Emiliano; Rothlisberger, Ursula; Cascella, Michele; Gauss, Jürgen | Journal of chemical theory and computation | 5241 | IAS-5 | 27.10.2022 |
| CHARMM Force-Field Parameters for Morphine, Heroin, and Oliceridine, and Conformational Dynamics of Opioid Drugs | Giannos, Thomas; Lešnik, Samo; Bren, Urban; Hodošček, Milan; Domratcheva, Tatiana; Bondar, Ana-Nicoleta | Journal of chemical information and modeling | 5241 | IAS-5 | 27.9.2022 |
| Innovative Non-PrP-Targeted Drug Strategy Designed to Enhance Prion Clearance | Colini Baldeschi, Arianna; Zattoni, Marco; Vanni, Silvia; Nikolic, Lea; Ferracin, Chiara; La Sala, Giuseppina; Summa, Maria; Bertorelli, Rosalia; Bertozzi, Sine Mandrup; Giachin, Gabriele; Carloni, Paolo; Bolognesi, Maria Laura; De Vivo, Marco; Legname, Giuseppe | Journal of medicinal chemistry | 5241 | IAS-5 | 23.9.2022 |
| A comparative study of receptor interactions between SARS-CoV and SARS-CoV-2 from molecular modeling | Lai, Hien T. T.; Nguyen, Ly H.; Phan, Anh D.; Kranjc Pietrucci, Agata; Nguyen, Toan T.; Nguyen-Manh, Duc | Journal of molecular modeling | 5241 | IAS-5 | 20.9.2022 |
| The geometric theory of phase transitions | Di Cairano, Loris | Journal of physics / A | Keine POF gefunden; wurde nicht gezählt! | IAS-5 | 20.9.2022 |
| Enhanced-Sampling Simulations for the Estimation of Ligand Binding Kinetics: Current Status and Perspective | Ahmad, Katya; Rizzi, Andrea; Capelli, Riccardo; Mandelli, Davide; Lyu, Wenping; Carloni, Paolo | Frontiers in molecular biosciences | 1215 | IAS-5 | 20.9.2022 |
| OLHA (N-oleoylhistamine) modulates activity of mouse brain histaminergic neurons | Sergeeva, Olga A.; Mazur, Karolina; Reiner-Link, David; Lutsenko, Kiril; Haas, Helmut L.; Alfonso-Prieto, Mercedes; Stark, Holger | Neuropharmacology | 5241, 5252 | IAS-5 | 27.6.2022 |
| Structure-function relationships of the disease-linked A218T oxytocin receptor variant | Meyer, Magdalena; Jurek, Benjamin; Alfonso-Prieto, Mercedes; Ribeiro, Rui; Milenkovic, Vladimir M.; Winter, Julia; Hoffmann, Petra; Wetzel, Christian H.; Giorgetti, Alejandro; Carloni, Paolo; Neumann, Inga D. | Molecular psychiatry | 5241, 5251, 5252 | IAS-5 | 27.6.2022 |
| Small-molecule modulators of TRMT2A decrease PolyQ aggregation and PolyQ-induced cell death | Margreiter, Michael A; Witzenberger, Monika; Wasser, Yasmine; Davydova, Elena; Janowski, Robert; Metz, Jonas; Habib, Pardes; Sahnoun, Sabri E. M.; Sobisch, Carina; Poma, Benedetta; Palomino-Hernandez, Oscar; Wagner, Mirko; Carell, Thomas; Shah, N. J.; Schulz, Jörg B.; Niessing, Dierk; Voigt, Aaron; Rossetti, Giulia | Computational and structural biotechnology journal | 5253, 5111 | INM-4, INM-11, JARA-BRAIN, JSC | 20.5.2022 |
| An anti-diabetic drug targets NEET (CISD) proteins through destabilization of their [2Fe-2S] clusters | Marjault, Henri-Baptiste; Karmi, Ola; Zuo, Ke; Michaeli, Dorit; Eisenberg-Domovich, Yael; Rossetti, Giulia; de Chassey, Benoit; Vonderscher, Jacky; Cabantchik, Ioav; Carloni, Paolo; Mittler, Ron; Livnah, Oded; Meldrum, Eric; Nechushtai, Rachel | Communications biology | 5252, 5111 | IAS-5, JSC | 17.5.2022 |
| Multiple Poses and Thermodynamics of Ligands Targeting Protein Surfaces: The Case of Furosemide Binding to mitoNEET in Aqueous Solution | Hoang Gia, Linh; Goßen, Jonas; Capelli, Riccardo; Nguyen, Toan T.; Sun, Zhaoxi; Zuo, Ke; Schulz, Jörg B.; Rossetti, Giulia; Carloni, Paolo | Frontiers in cell and developmental biology | 5252, 5251, 5111 | IAS-5, JSC | 27.4.2022 |
| Hamiltonian chaos and differential geometry of configuration space–time | Di Cairano, Loris; Gori, Matteo; Pettini, Giulio; Pettini, Marco | Physica / D | Keine POF gefunden; wurde nicht gezählt! | IAS-5 | 1.2.2022 |
Hierzu zählen Publikationen in Journals, die nicht unter (A) fallen. Die Vergabe einer DOI ist zwingende Voraussetzung. Sonderfall Erde und Umwelt: Hier zählen einschließlich Bücher und Buchkapitel.
Anzahl zählbare Publikationen: 1
| Titel | Autoren | Journal/Konferenz | POF | andere Institute | zuletzt geändert |
|---|---|---|---|---|---|
| Structural Foundations of Potassium Selectivity in Channelrhodopsins | Govorunova, Elena G.; Sineshchekov, Oleg A.; Brown, Leonid S.; Bondar, Ana-Nicoleta; Spudich, John L. | mBio | 5241 | IAS-5 | 24.1.2023 |
Hierzu zählen Publikationen, die in Jülich DATA verzeichnet sind.
Fehlende POF-Zuordnungen muss man in Jülich DATA nachtragen. Bitte beachten Sie, dass diese Nachtragungen dann aber erst für das folgende Berichtsjahr gewertet werden, weil die Deadline für 2022 bereits verstrichen ist.
Anzahl zählbare Publikationen: 0
| Titel | Autoren | POF | andere Institute | zuletzt geändert | |
|---|---|---|---|---|---|
| keine | |||||
Hierzu zählen Publikationen, die in Jülich DATA verzeichnet sind.
Fehlende POF-Zuordnungen muss man in Jülich DATA nachtragen. Bitte beachten Sie, dass diese Nachtragungen dann aber erst für das folgende Berichtsjahr gewertet werden, weil die Deadline für 2022 bereits verstrichen ist.
Anzahl zählbare Publikationen: 0
| Titel | Autoren | POF | andere Institute | zuletzt geändert | |
|---|---|---|---|---|---|
| keine | |||||