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Die Publikationen in den Abschnitten A und B sind alle Text-Publikationen, die nach Stand 27.7.2024 für die Programmberichte bzw. den Zentrenfortschrittsbericht für das Jahr 2024 gemeldet werden. Jülicher Autoren sind fett gedruckt.
Stellen Sie bitte sicher, dass dies auch alle Publikationen sind, die aus Ihrem Institut bzw. Institutsbereich gemeldet werden sollen. Als einen Anhaltspunkt für eventuelle Nachtragungen können Sie einen Abgleich mit im „Web of Science“ gefundenen Publikationen nehmen, der stets Anfang November von der Zentralbibliothek verschickt wird.
Beachten Sie, dass u.U. einige der Publikationen in den Abschnitten A bis D noch keine POF-Zuordnung haben. Tragen Sie diese bitte nach, ansonsten werden die betroffenen Publikationen nicht gezählt.
Die Publikationsliste dieses Berichtes gibt es auch als ODS-Datei, allerdings ist nur die aktuelle Webseite verbindlich für das Berichtswesen.
Diese Seite ist ein Dienst der ZB. Fragen können Sie richten an: juser@fz-juelich.de
Der Quellcode, der diesen Bericht erstellt, ist frei verfügbar.
Hierzu zählen Publikationen in Journals, die entweder in der Master Journal List „Web of Science Core Collection“ von Clarivate Analytics oder in der „Scopus Source List“ von Elsevier gelistet sind.
Anzahl zählbare Publikationen: 18
| Titel | Autoren | Journal/Konferenz | POF | andere Institute | zuletzt geändert |
|---|---|---|---|---|---|
| 3D DFT by block tensor-matrix multiplication via a modified Cannon's algorithm: Implementation and scaling on distributed-memory clusters with fat tree networks | Lippert, Thomas; Mandelli, Davide; Malapally, Nitin; Bolnykh, Viacheslav; Suarez, Estela; Carloni, Paolo | Journal of parallel and distributed computing | 5241 | IAS-5, JSC, INM-11 | 16.7.2024 |
| Multiscale biomolecular simulations in the exascale era | Carrasco-Busturia, David; Ippoliti, Emiliano; Meloni, Simone; Rothlisberger, Ursula; Olsen, Jógvan Magnus Haugaard | Current opinion in structural biology | 5241 | 16.7.2024 | |
| All-Atom Biomolecular Simulation in the Exascale Era | Beck, Thomas L.; Carloni, Paolo; Asthagiri, Dilipkumar N. | Journal of chemical theory and computation | 5241 | IAS-5 | 16.7.2024 |
| Calcium-Driven In Silico Inactivation of a Human Olfactory Receptor | Capelli, Riccardo; Pirona, Lorenza; Ballabio, Federico; Alfonso-Prieto, Mercedes | Journal of chemical information and modeling | 5241 | IAS-5 | 16.7.2024 |
| MiMiC: A high-performance framework for multiscale molecular dynamics simulations | Ippoliti, Emiliano; Meloni, Simone; Antalík, Andrej; Das, Sambit; Mandelli, Davide; Carrasco-Busturia, David; Carloni, Paolo; Rothlisberger, Ursula; Olsen, Jógvan Magnus Haugaard; Gavini, Vikram; Mouvet, François; Levy, Andrea; Johnson, Sophia K.; Acocella, Angela; Kvedaravičiūtė, Sonata; Raghavan, Bharath | The journal of chemical physics | 5241 | 16.7.2024 | |
| Routing a quantum state in a bio-inspired network | Franzosi, Roberto; Faraji, Elham; Nourmandipour, Alireza; Mancini, Stefano; Pettini, Marco | Quantum information processing | 899 | 16.7.2024 | |
| Protons at bio-interfaces | Bondar, Ana-Nicoleta; Barboiu, Mihail | Biochimica et biophysica acta / Biomembranes | 5241 | IAS-5 | 9.4.2024 |
| Fentanyl and the Fluorinated Fentanyl Derivative NFEPP Elicit Distinct Hydrogen-Bond Dynamics of the Opioid Receptor | Lešnik, Samo; Bren, Urban; Domratcheva, Tatiana; Bondar, Ana-Nicoleta | Journal of chemical information and modeling | 5241 | IAS-5 | 9.4.2024 |
| Modeling the Orthosteric Binding Site of the G Protein-Coupled Odorant Receptor OR5K1 | Krautwurst, Dietmar; Nicoli, Alessandro; Haag, Franziska; He, Ruiming; Marcinek, Patrick; Kreißl, Johanna; Stein, Jörg; Di Pizio, Antonella; Marchetto, Alessandro; Dunkel, Andreas; Hofmann, Thomas | Journal of chemical information and modeling | 5241 | IAS-5 | 9.4.2024 |
| Transport mechanisms of DgoT—a bacterial homolog of organic anion transporters | Fahlke, Christoph M.; Dmitrieva, Nataliia; Gholami, Samira; Alleva, Claudia; Alfonso-Prieto, Mercedes; Carloni, Paolo | Biophysical journal | 5241 | IBI-1, IAS-5 | 9.4.2024 |
| Exploring the transport cycle of DgoT, a bacterial homolog of human vesicular glutamate transporters | Fahlke, Christoph M.; Dmitrieva, Nataliia; Alleva, Claudia; Alfonso-Prieto, Mercedes; Carloni, Paolo | Biophysical journal | 5241 | IBI-1, IAS-5 | 9.4.2024 |
| Free energies at QM accuracy from force fields via multimap targeted estimation | Carloni, Paolo; Parrinello, Michele; Rizzi, Andrea | Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America | 5241 | IAS-5 | 9.4.2024 |
| A Proteorhodopsin-Related Photosensor Expands the Repertoire of Structural Motifs Employed by Sensory Rhodopsins | Heberle, Joachim; Saliminasab, Maryam; Schubert, Luiz; Harris, Andrew; Brown, Leonid S.; Yamazaki, Yoichi; Langner, Pit; Palmateer, Alyssa; Bondar, Ana-Nicoleta | The journal of physical chemistry / B | 5241 | IAS-5 | 9.4.2024 |
| Graph-Based Analyses of Dynamic Water-Mediated Hydrogen-Bond Networks in Phosphatidylserine: Cholesterol Membranes | Karathanou, Konstantina; Bondar, Ana-Nicoleta; Jain, Honey | Biomolecules | 5142 | IAS-5 | 9.4.2024 |
| Unexpected Single-Ligand Occupancy and Negative Cooperativity in the SARS-CoV-2 Main Protease | Storici, Paola; Rizzi, Valerio; Carloni, Paolo; Nguyen, Toan T.; Hoang, Gia Linh; Costanzi, Elisa; Kuzikov, Maria; Zaliani, Andrea; Bolm, Carsten; Ansari, Narjes; Albani, Simone; Rossetti, Giulia; Demitri, Nicola; Schulz, Jörg B.; Frings, Marcus | Journal of chemical information and modeling | 899 | IAS-5 | 9.4.2024 |
| Protons taken hostage: Dynamic H-bond networks of the pH-sensing GPR68 | Kapur, Bhav; Baldessari, Filippo; Lazaratos, Michalis; Nar, Herbert; Schnapp, Gisela; Giorgetti, Alejandro; Bondar, Ana-Nicoleta | Computational and structural biotechnology journal | 5241 | IAS-5 | 9.4.2024 |
| Structures of channelrhodopsin paralogs in peptidiscs explain their contrasting K+ and Na+ selectivities | Bondar, Ana-Nicoleta; Askari, Azam; Morizumi, Takefumi; Sineshchekov, Oleg A.; Wang, Yumei; Govorunova, Elena G.; Zheng, Lei; Li, Hai; Brown, Leonid S.; Ernst, Oliver P.; Bertalan, Éva; Spudich, John L.; Kim, Kyumhyuk | Nature Communications | 5241 | IAS-5 | 9.4.2024 |
| Modelling eNvironment for Isoforms (MoNvIso): A general platform to predict structural determinants of protein isoforms in genetic diseases | Giorgetti, Alejandro; De Rubeis, Silvia; Sorokina, Oksana; Armstrong, Douglas J.; Carloni, Paolo; Ruggerone, Paolo; Oliva, Francesco; Musiani, Francesco | Frontiers in Chemistry | 5241 | IAS-5 | 9.4.2024 |
| pyGOMoDo: GPCRs modeling and docking with python | Ribeiro, Rui P; Giorgetti, A. | Bioinformatics | 5241 | IAS-5 | 9.4.2024 |
| Kinetic and structural details of urease inactivation by thiuram disulphides | Mazzei, Luca; Paul, Arundhati; Cianci, Michele; Devodier, Marta; Mandelli, Davide; Carloni, Paolo; Ciurli, Stefano | Journal of inorganic biochemistry | 5241 | IAS-5 | 5.12.2023 |
Hierzu zählen Publikationen in Journals, die nicht unter (A) fallen. Die Vergabe einer DOI ist zwingende Voraussetzung. Sonderfall Erde und Umwelt: Hier zählen einschließlich Bücher und Buchkapitel.
Anzahl zählbare Publikationen: 0
| Titel | Autoren | Journal/Konferenz | POF | andere Institute | zuletzt geändert |
|---|---|---|---|---|---|
| Structural Determinants of Peptide Nanopore Formation | Ana-Nicoleta Bondar | ACS Nano | Keine POF gefunden; würde nicht gezählt! | 27.7.2024 | |
| Hydrogen-Bonding and Hydrophobic Interaction Networks as Structural Determinants of Microbial Rhodopsin Function | Ana-Nicoleta Bondar | The journal of physical chemistry. B | Keine POF gefunden; würde nicht gezählt! | 27.7.2024 |
Hierzu zählen Publikationen, die in Jülich DATA verzeichnet sind.
Fehlende POF-Zuordnungen muss man in Jülich DATA nachtragen.
Anzahl zählbare Publikationen: 0
| Titel | Autoren | POF | andere Institute | zuletzt geändert |
|---|---|---|---|---|
| Molecular Dynamics Trajectories Exploring the Impact of Phosphorylation on the Physiological Form of Human alpha-Synuclein in Aqueous Solution | Paolo Carloni; Emile de Bruyn; Giulia Rossetti; Jörg B. Schulz | Keine POF gefunden; würde nicht gezählt! | JSC, INM-11 | 27.7.2024 |
| Molecular Dynamics Trajectories Exploring the Impact of Phosphorylation on the Physiological Form of Human alpha-Synuclein in Aqueous Solution | Paolo Carloni; Emile de Bruyn; Giulia Rossetti; Jörg B. Schulz | Keine POF gefunden; würde nicht gezählt! | JSC, INM-11 | 27.7.2024 |
Hierzu zählen Publikationen, die in Jülich DATA verzeichnet sind.
Fehlende POF-Zuordnungen muss man in Jülich DATA nachtragen.
Anzahl zählbare Publikationen: 0
| Titel | Autoren | POF | andere Institute | zuletzt geändert | |
|---|---|---|---|---|---|
| keine | |||||